RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GVY2 172 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1B0GW54 56 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PNM2 257 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 BCE1O60756 84 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf137Q5JT78 98 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 DPH3Q96FX2 82 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 CXCL6P80162 114 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8NBF4 154 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRR4Q96PI1 79 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WVE0 104 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2AP49459 152 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 HAMPP81172 84 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFL1Q6UW32 110 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 F8WEM9 126 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC179H3BU77 68 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 ATOX1O00244 68 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 CRYGAP11844 174 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 NREPQ16612 68 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 PKHD1P08F94 4074 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-2P60368 255 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 RYR1P21817 5038 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JQZ4 141 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00483Q53H64 154 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 SCXQ7RTU7 201 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 COX7CP15954 63 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 BPY2O14599 106 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF861PO60384 105 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 IGKV4-1P06312 121 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 UQCRQO14949 82 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZSA8 131 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 SERP2Q8N6R1 65 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 PKD1P98161 4303 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP10-1P60331 282 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 DSCR10P59022 87 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPG2P98160 4391 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV7-43P04211 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N9L7 120 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087WSZ3 146 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 CDK2AP2O75956 126 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 Q8N1X5 172 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 K7EQZ3 153 aa6.43□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 OCR1Q9BZK8 76 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 MOBPQ13875 183 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP2-209ENST00000504450 Q96NJ1 140 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 A8MWP4 228 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 J3KT08 172 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 HCG22E2RYF7 251 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 PRR15Q8IV56 129 aa6.37□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 CD164Q04900 197 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 C20orf197Q8N268 126 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 KLKP1Q107X0 134 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 Q5VSD8 79 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087X002 238 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0U1RQV1 116 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM258P61165 79 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 H7BZZ5 65 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-209ENST00000504450 SNURFQ9Y675 71 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms