RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.02□□□□□ -1.61
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USP4-211ENST00000485450 COX7BP24311 80 aa5.02□□□□□ -1.61
USP4-211ENST00000485450 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
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USP4-211ENST00000485450 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.01□□□□□ -1.61
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USP4-211ENST00000485450 C10orf25Q5T742 122 aa4.97□□□□□ -1.61
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USP4-211ENST00000485450 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.96□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 Q75L30 129 aa4.96□□□□□ -1.62
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USP4-211ENST00000485450 LIMD2Q9BT23 127 aa4.96□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 TENM2Q9NT68 2774 aa4.95□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.95□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 PRR34Q9NV39 138 aa4.95□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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USP4-211ENST00000485450 KLK12Q9UKR0 248 aa4.94□□□□□ -1.62
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USP4-211ENST00000485450 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.93□□□□□ -1.62
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USP4-211ENST00000485450 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.93□□□□□ -1.62
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USP4-211ENST00000485450 PRR15LQ9BU68 103 aa4.91□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.91□□□□□ -1.62
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USP4-211ENST00000485450 Q9BRP9 147 aa4.9□□□□□ -1.62
USP4-211ENST00000485450 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.89□□□□□ -1.63
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USP4-211ENST00000485450 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP4-211ENST00000485450 A6NED7 52 aa4.88□□□□□ -1.63
USP4-211ENST00000485450 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.87□□□□□ -1.63
USP4-211ENST00000485450 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.87□□□□□ -1.63
USP4-211ENST00000485450 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP4-211ENST00000485450 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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USP4-211ENST00000485450 SPINK7P58062 85 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP4-211ENST00000485450 K7EQZ3 153 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP4-211ENST00000485450 REG3AQ06141 175 aa4.83□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 Q8N377 158 aa4.83□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 H3BPC8 53 aa4.82□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 SPRR4Q96PI1 79 aa4.82□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.82□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 LY6G6CO95867 125 aa4.82□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.82□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 Q8NBF4 154 aa4.81□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.81□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 CDK2AP2O75956 126 aa4.8□□□□□ -1.64
USP4-211ENST00000485450 A0A087WTM6 91 aa4.8□□□□□ -1.64
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