RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP4-211ENST00000485450 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.42□□□□□ -0.1
USP4-211ENST00000485450 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
USP4-211ENST00000485450 HMGXB3Q12766 1538 aa14.39□□□□□ -0.11
USP4-211ENST00000485450 SMARCA2P51531 1590 aa14.37□□□□□ -0.11
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USP4-211ENST00000485450 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.22□□□□□ -0.13
USP4-211ENST00000485450 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.21□□□□□ -0.13
USP4-211ENST00000485450 PRDM2Q13029 1718 aa14.12□□□□□ -0.15
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USP4-211ENST00000485450 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
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USP4-211ENST00000485450 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
USP4-211ENST00000485450 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.96□□□□□ -0.17
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USP4-211ENST00000485450 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.15□□□□□ -0.3
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USP4-211ENST00000485450 ADAMTS12P58397 1594 aa13.11□□□□□ -0.31
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USP4-211ENST00000485450 CEP170Q5SW79 1584 aa12.91□□□□□ -0.34
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USP4-211ENST00000485450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 36.9
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USP4-211ENST00000485450 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
USP4-211ENST00000485450 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.73□□□□□ -0.37
USP4-211ENST00000485450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.72□□□□□ -0.37
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