RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-210ENST00000477812 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 MOBPQ13875 183 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 HERC1Q15751 4861 aa11.64□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 H3BUT2 72 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 TRACP01848 142 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.61□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 TCL1BO95988 128 aa11.6□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 Q8NBF4 154 aa11.6□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.59□□□□□ -0.55
ACTB-210ENST00000477812 DNAL4O96015 105 aa11.58□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.58□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PPM0 123 aa11.57□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.57□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 FABP2P12104 132 aa11.56□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 ATXN8Q156A1 80 aa11.55□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.55□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 GHRHP01286 108 aa11.53□□□□□ -0.56
ACTB-210ENST00000477812 H3BQ85 93 aa11.51□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 F8WEM9 126 aa11.5□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.5□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 A0A0G2JQZ4 141 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 SPCS1Q9Y6A9 102 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GV90 55 aa11.46□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 UBE2V1Q13404 147 aa11.46□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.46□□□□□ -0.57
ACTB-210ENST00000477812 SPINK1P00995 79 aa11.45□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.45□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 Q6JHZ5 121 aa11.45□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 K7EP34 96 aa11.44□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.44□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 IGFL1Q6UW32 110 aa11.44□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 CD164Q04900 197 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 C9JAW5 83 aa11.42□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 H3BMG7 143 aa11.42□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.4□□□□□ -0.58
ACTB-210ENST00000477812 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.39□□□□□ -0.59
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.39□□□□□ -0.59
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GV72 72 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-210ENST00000477812 MTURNQ8N3F0 131 aa11.35□□□□□ -0.59
ACTB-210ENST00000477812 H3BT86 120 aa11.34□□□□□ -0.59
ACTB-210ENST00000477812 Q5XG85 94 aa11.33□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.32□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 Q6Q795 121 aa11.32□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.32□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.31□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 PRO0461Q9UI25 63 aa11.31□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PNM2 257 aa11.3□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.3□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 LIMD2Q9BT23 127 aa11.3□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 TEN1Q86WV5 123 aa11.28□□□□□ -0.6
ACTB-210ENST00000477812 F8W1H4 67 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.27□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 DSCR8Q96T75 97 aa11.25□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 PRR4Q16378 134 aa11.23□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 CCKP06307 115 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.22□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 Q6ZQT0 140 aa11.21□□□□□ -0.61
ACTB-210ENST00000477812 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.2□□□□□ -0.62
ACTB-210ENST00000477812 A0A087WSZ3 146 aa11.19□□□□□ -0.62
ACTB-210ENST00000477812 C1orf195Q5TG92 126 aa11.19□□□□□ -0.62
ACTB-210ENST00000477812 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.17□□□□□ -0.62
ACTB-210ENST00000477812 PDE6GP18545 87 aa11.17□□□□□ -0.62
ACTB-210ENST00000477812 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.15□□□□□ -0.62
ACTB-210ENST00000477812 LPAP08519 4548 aa11.15□□□□□ -0.63
ACTB-210ENST00000477812 LRP2P98164 4655 aa11.14□□□□□ -0.63
ACTB-210ENST00000477812 VPS25Q9BRG1 176 aa11.14□□□□□ -0.63
ACTB-210ENST00000477812 Q96NJ1 140 aa11.11□□□□□ -0.63
ACTB-210ENST00000477812 TPRXLQ17RH7 258 aa11.1□□□□□ -0.63
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.09□□□□□ -0.63
ACTB-210ENST00000477812 A0A1B0GW54 56 aa11.08□□□□□ -0.64
ACTB-210ENST00000477812 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.08□□□□□ -0.64
ACTB-210ENST00000477812 ETDBQ3ZM63 59 aa11.08□□□□□ -0.64
ACTB-210ENST00000477812 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.04□□□□□ -0.64
ACTB-210ENST00000477812 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.97□□□□□ -0.65
ACTB-210ENST00000477812 IGKV4-1P06312 121 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 CDIP1Q9H305 208 aa10.94□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 SIGMAR1Q99720 223 aa10.93□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 J3QR89 54 aa10.92□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 C9orf92A6NGG3 77 aa10.91□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 XP32Q5T750 250 aa10.9□□□□□ -0.66
ACTB-210ENST00000477812 J3KT08 172 aa10.88□□□□□ -0.67
ACTB-210ENST00000477812 NREPQ16612 68 aa10.88□□□□□ -0.67
ACTB-210ENST00000477812 K7ERU9 68 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTB-210ENST00000477812 LINC00846Q9NV44 126 aa10.87□□□□□ -0.67
ACTB-210ENST00000477812 Q6ZVQ6 151 aa10.86□□□□□ -0.67
ACTB-210ENST00000477812 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.84□□□□□ -0.67
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