RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF861P	O60384	105 aa		7.51	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MT-ATP8	P03928	68 aa		7.51	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00846	Q9NV44	126 aa		7.51	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV7-43	P04211	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.49	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	RYR2	Q92736	4967 aa		7.49	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00643	Q86TS7	51 aa		7.48	□□□□□ -1.21
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		7.46	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00483	Q53H64	154 aa		7.46	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	UBL5	Q9BZL1	73 aa		7.46	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PNM2	257 aa		7.45	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6JHZ5	121 aa		7.45	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	IGFL1	Q6UW32	110 aa		7.45	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435		Q8NBF4	154 aa		7.45	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		7.42	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6ZVQ6	151 aa		7.42	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.41	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0G2JQZ4	141 aa		7.41	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.41	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		7.41	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GW54	56 aa		7.4	□□□□□ -1.22
HDLBP-231	ENST00000467435	SCGB1A1	P11684	91 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435		Q6Q795	121 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	CRYGA	P11844	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	RYR3	Q15413	4870 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	IMUP	Q9GZP8	106 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	MOBP	Q13875	183 aa		7.36	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	NREP	Q16612	68 aa		7.35	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435	PKHD1	P08F94	4074 aa		7.34	□□□□□ -1.23
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A087WSZ3	146 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	CXCL6	P80162	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	BPY2	O14599	106 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.3	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A087WVE0	104 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	PCP4	P48539	62 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.29	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A087X002	238 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.28	□□□□□ -1.24
HDLBP-231	ENST00000467435	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.25	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435		Q8N9L7	120 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV4-1	P06312	121 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK2AP2	O75956	126 aa		7.22	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	CD164	Q04900	197 aa		7.22	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		7.22	□□□□□ -1.25
HDLBP-231	ENST00000467435	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	DSCR10	P59022	87 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435		K7EQZ3	153 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	ATOX1	O00244	68 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.18	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435		Q96NJ1	140 aa		7.18	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435		J3KT08	172 aa		7.17	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		7.17	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435		Q5VSD8	79 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	FAT1	Q14517	4588 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435		A8MWP4	228 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.15	□□□□□ -1.26
HDLBP-231	ENST00000467435	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		7.13	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		7.12	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	PRR15	Q8IV56	129 aa		7.12	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	LIMD2	Q9BT23	127 aa		7.12	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPG2	P98160	4391 aa		7.11	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	HCG22	E2RYF7	251 aa		7.11	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.11	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	NDUFB1	O75438	58 aa		7.1	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435		Q5XG85	94 aa		7.1	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		7.1	□□□□□ -1.27
HDLBP-231	ENST00000467435	SPINK1	P00995	79 aa		7.08	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		7.08	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.08	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	COX7C	P15954	63 aa		7.07	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		7.07	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		7.07	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		7.06	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1B0GVX0	72 aa		7.06	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.06	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		7.05	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	CASC2	Q6XLA1	102 aa		7.05	□□□□□ -1.28
HDLBP-231	ENST00000467435	RYR1	P21817	5038 aa		7.05	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms