RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.22□□□□□ -2.05
CBX1P4-201ENST00000439415 SPTBP11277 2137 aa2.22□□□□□ -2.05
CBX1P4-201ENST00000439415 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 FCER1GP30273 86 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf128Q5T292 105 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.21□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 COL7A1Q02388 2944 aa2.21□□□□□ -2.06
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CBX1P4-201ENST00000439415 TENM2Q9NT68 2774 aa2.2□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.2□□□□□ -2.06
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CBX1P4-201ENST00000439415 CLPSL1A2RUU4 121 aa2.2□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa2.2□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 C22orf24Q9Y442 160 aa2.2□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 HMGN4O00479 90 aa2.19□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 PIN1P1O15428 100 aa2.19□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-30P01768 117 aa2.19□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.19□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 CSAG1Q6PB30 78 aa2.19□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TENM3Q9P273 2699 aa2.19□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01546A6NGU7 62 aa2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 D6R8Y8 96 aa2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SPINK4O60575 86 aa2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 FXYD6P3P58550 94 aa2.18□□□□□ -2.06
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CBX1P4-201ENST00000439415 PRR15LQ9BU68 103 aa2.18□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 MED12Q93074 2177 aa2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 FREM3P0C091 2139 aa2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 STATHP02808 62 aa2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-1P60331 282 aa2.17□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.17□□□□□ -2.06
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CBX1P4-201ENST00000439415 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.16□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC13O75165 2243 aa2.16□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0J9YY99 117 aa2.16□□□□□ -2.06
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP10-10P60014 251 aa2.16□□□□□ -2.06
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CBX1P4-201ENST00000439415 DNAL4O96015 105 aa2.15□□□□□ -2.07
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CBX1P4-201ENST00000439415 WFDC6Q9BQY6 131 aa2.15□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.14□□□□□ -2.07
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CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.14□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 ROS1P08922 2347 aa2.13□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 HSPG2P98160 4391 aa2.13□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 IGIPA6NJ69 53 aa2.13□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 ENHOQ6UWT2 76 aa2.13□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL19Q99731 98 aa2.13□□□□□ -2.07
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CBX1P4-201ENST00000439415 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.13□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 KMT2AQ03164 3969 aa2.13□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A096LNT2 108 aa2.12□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.12□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 HIGD1CA8MV81 97 aa2.12□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.12□□□□□ -2.07
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CBX1P4-201ENST00000439415 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.12□□□□□ -2.07
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CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB110Q30KQ9 67 aa2.11□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 Q86TA4 180 aa2.11□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 WFDC9Q8NEX5 89 aa2.11□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.11□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.11□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.1□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB108AA8MXU0 73 aa2.1□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.1□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R17O96001 155 aa2.1□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 SPAG11BQ08648 103 aa2.1□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.1□□□□□ -2.07
CBX1P4-201ENST00000439415 COX14Q96I36 57 aa2.1□□□□□ -2.07
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