RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FAT3Q8TDW7 4589 aa12.21□□□□□ -0.45
HOXA4-202ENST00000428284 GHRHP01286 108 aa12.21□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.21□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.21□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 OXTP01178 125 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.2□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM29Q86T20 159 aa12.18□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.17□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 H3BMG7 143 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 J3QL48 77 aa12.16□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 H3BQ85 93 aa12.15□□□□□ -0.46
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HOXA4-202ENST00000428284 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.15□□□□□ -0.46
HOXA4-202ENST00000428284 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 F8WEM9 126 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.14□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 C9JAW5 83 aa12.13□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 HERC1Q15751 4861 aa12.13□□□□□ -0.47
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HOXA4-202ENST00000428284 K7EP34 96 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.12□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 Q8NBF4 154 aa12.11□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP10-8P60410 259 aa12.1□□□□□ -0.47
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HOXA4-202ENST00000428284 UBE2V1Q13404 147 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXA4-202ENST00000428284 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXA4-202ENST00000428284 TNXBP22105 4242 aa12.06□□□□□ -0.48
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HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXA4-202ENST00000428284 H3BT86 120 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXA4-202ENST00000428284 Q6JHZ5 121 aa12□□□□□ -0.49
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0G2JQZ4 141 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXA4-202ENST00000428284 PRO0461Q9UI25 63 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXA4-202ENST00000428284 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXA4-202ENST00000428284 IGFL1Q6UW32 110 aa11.97□□□□□ -0.49
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HOXA4-202ENST00000428284 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXA4-202ENST00000428284 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.94□□□□□ -0.5
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HOXA4-202ENST00000428284 SPINK1P00995 79 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXA4-202ENST00000428284 CD164Q04900 197 aa11.89□□□□□ -0.51
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HOXA4-202ENST00000428284 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA4-202ENST00000428284 Q6Q795 121 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXA4-202ENST00000428284 LIMD2Q9BT23 127 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXA4-202ENST00000428284 PDE6GP18545 87 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXA4-202ENST00000428284 Q6ZQT0 140 aa11.8□□□□□ -0.52
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HOXA4-202ENST00000428284 A0A087WSZ3 146 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA4-202ENST00000428284 Q5XG85 94 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA4-202ENST00000428284 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA4-202ENST00000428284 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA4-202ENST00000428284 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA4-202ENST00000428284 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1B0GW54 56 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA4-202ENST00000428284 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA4-202ENST00000428284 PRR4Q16378 134 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf195Q5TG92 126 aa11.63□□□□□ -0.55
HOXA4-202ENST00000428284 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
HOXA4-202ENST00000428284 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.56□□□□□ -0.56
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HOXA4-202ENST00000428284 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.54□□□□□ -0.56
HOXA4-202ENST00000428284 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.53□□□□□ -0.56
HOXA4-202ENST00000428284 IGKV4-1P06312 121 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXA4-202ENST00000428284 SIGMAR1Q99720 223 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00846Q9NV44 126 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXA4-202ENST00000428284 Q6ZVQ6 151 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXA4-202ENST00000428284 UBL5Q9BZL1 73 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXA4-202ENST00000428284 ACYP1P07311 99 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 J3KT08 172 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 J3QR89 54 aa11.42□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 TPRXLQ17RH7 258 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.4□□□□□ -0.58
HOXA4-202ENST00000428284 C9orf92A6NGG3 77 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXA4-202ENST00000428284 BPY2O14599 106 aa11.39□□□□□ -0.59
HOXA4-202ENST00000428284 LPAP08519 4548 aa11.38□□□□□ -0.59
HOXA4-202ENST00000428284 LRP2P98164 4655 aa11.37□□□□□ -0.59
HOXA4-202ENST00000428284 A8MWP4 228 aa11.35□□□□□ -0.59
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