RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIOO75962 3097 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 FANCAO15360 1455 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP10BO94823 1461 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 RGPD2P0DJD1 1756 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 M0R143 59 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-57P-201ENST00000411348 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 QSER1Q2KHR3 1735 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 LAMA3Q16787 3333 aa-0.72□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLXNC1O60486 1568 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 ALKQ9UM73 1620 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 LCE6AA0A183 80 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 ACYP1P07311 99 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 C4AP0C0L4 1744 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 C4BP0C0L5 1744 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLIN4Q96Q06 1357 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-0.73□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 WIZO95785 1651 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 IAPPP10997 89 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYH4Q9Y623 1939 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT1XP80297 61 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 RABAC1Q9UI14 185 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEPDC5O75140 1603 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 USP32Q8NFA0 1604 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 BPTFQ12830 3046 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 RELNP78509 3460 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 RGPD1P0DJD0 1748 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 NWD1Q149M9 1564 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 NCOA2Q15596 1464 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 NDUFA4O00483 81 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 COL12A1Q99715 3063 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 PKIAP61925 76 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-57P-201ENST00000411348 LRBAP50851 2863 aa-0.78□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 S100A8P05109 93 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 TNP1P09430 55 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 WT1-ASQ06250 92 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 CEP162Q5TB80 1403 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT1EP04732 61 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 NREPQ16612 68 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 Q9H521 79 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 NESP48681 1621 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 ITPR1Q14643 2758 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 VPS8Q8N3P4 1428 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 CRIP1P50238 77 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-57P-201ENST00000411348 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.81□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms