RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 BPY2O14599 106 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV6-57P01721 117 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0B4J2C4 111 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR4Q96PI1 79 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 ETDBQ3ZM63 59 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 CASC2Q6XLA1 102 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 PDE6GP18545 87 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 MT-ATP8P03928 68 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV2-30P06310 120 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVY2 172 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GX51 115 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 J3KT08 172 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 TRIAP1O43715 76 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC179H3BU77 68 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZVQ6 151 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JQZ4 141 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00313P59037 77 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00575Q6W349 94 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 ERC2-IT1O76042 136 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 TEN1Q86WV5 123 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 SEC61GP60059 68 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 Q8NDZ9 215 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01600Q96MT4 127 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 MP68P56378 58 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 V9GYY9 64 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 DSCR10P59022 87 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087X002 238 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 IMUPQ9GZP8 106 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRC-201ENST00000348564 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 LYSTQ99698 3801 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 hDV103S1A0JD37 113 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 PRO0628Q9UI54 55 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 PCOTHQ58A44 107 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 H3BT86 120 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 UQCRQO14949 82 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 IGFL1Q6UW32 110 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 PRO0461Q9UI25 63 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N377 158 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 KMT2AQ03164 3969 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 HCG22E2RYF7 251 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf195Q5TG92 126 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR1AP35321 89 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 C4orf26Q17RF5 130 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf87E5RJ46 101 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM258P61165 79 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 CD164Q04900 197 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 COX7CP15954 63 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM29Q86T20 159 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N9L7 120 aa2.58□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 ATOX1O00244 68 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 ACYP1P07311 99 aa2.57□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH2Q9P225 4427 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms