RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538971.6

ERC1-208, Transcript of ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1, human

TSL 2

Gene ERC1, Length 2,267 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERC1-208	ENST00000538971		Q1T7F1	81 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	PSPHP1	O15172	72 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	FSHB	P01225	129 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	DAD1	P61803	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	FBN3	Q75N90	2809 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971		M0R2N4	97 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	SORL1	Q92673	2214 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	hDV103S1	A0JD37	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ERC1-208	ENST00000538971	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	STAB1	Q9NY15	2570 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971		A0A1B0GUV1	79 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	COX7B	P24311	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	LCE6A	A0A183	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	MP68	P56378	58 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	C16orf74	Q96GX8	76 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	IGKV4-1	P06312	121 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971		Q6ZQY7	126 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	ANK2	Q01484	3957 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971		Q8NBF4	154 aa		5	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971		A0A1B0GW54	56 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971		A0A087X002	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERC1-208	ENST00000538971		A0A0J9YWU9	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	LINC00313	P59037	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971		Q8NDZ9	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	PRR4	Q16378	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	UBE2B	P63146	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	VWF	P04275	2813 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	NDUFB1	O75438	58 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971		Q8N9L7	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	PSCA	O43653	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	UBE2A	P49459	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERC1-208	ENST00000538971		A8MUN3	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971		M0R378	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971		Q5VV11	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ERC1-208	ENST00000538971	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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