RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340		Q8NDZ9	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A1B0GUV1	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	WFDC2	Q14508	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340		Q6ZQT7	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340		Q86TA4	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A0B4J2C4	111 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	DEFB1	P60022	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340		Q6ZTC4	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MFSD8-223	ENST00000641340	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A1B0GUT8	65 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340		A8MUU9	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	FXYD2	P54710	66 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340		Q8N814	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340		Q8TAT8	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	CCK	P06307	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340		Q1RN00	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	XCL1	P47992	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ATOX1	O00244	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	CRIP1	P50238	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ANK2	Q01484	3957 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340		D6R8Y8	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	ROMO1	P60602	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	PRR9	Q5T870	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	RHOH	Q15669	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MFSD8-223	ENST00000641340	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340		A0A0J9YX75	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	DEFB131A	P59861	70 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	ESRG	Q1W209	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	MUC4	Q99102	2169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340		Q6ZQT0	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	CRP	P02741	224 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	FCER1G	P30273	86 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340		A8MTW9	85 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340		K7EMI3	77 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340		Q1T7F1	81 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.49	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	CFC1	P0CG37	223 aa		4.48	□□□□□ -1.69
MFSD8-223	ENST00000641340	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.8 ms