RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 LRRK2Q5S007 2527 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 LY6HO94772 140 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 DNAL4O96015 105 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 CRPP02741 224 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.23□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 CENPEQ02224 2701 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-204ENST00000542443 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
TRDN-204ENST00000542443 SYNJ2BPP57105 145 aa3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-204ENST00000542443 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
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TRDN-204ENST00000542443 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.21□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 NPC2P61916 151 aa3.21□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 C16orf95Q9H693 158 aa3.21□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 LECT2O14960 151 aa3.18□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 PDE6GP18545 87 aa3.18□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 PFN2P35080 140 aa3.18□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 Q6ZQT0 140 aa3.18□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.18□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 TACC2O95359 2948 aa3.16□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.16□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 KNCNA6PVL3 124 aa3.16□□□□□ -1.9
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TRDN-204ENST00000542443 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.16□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 UBL5Q9BZL1 73 aa3.16□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.16□□□□□ -1.9
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