RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	CCL19	Q99731	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	LY6H	O94772	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	CR1	P17927	2039 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329		H3BQ85	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	OXT	P01178	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	FHL2	Q14192	279 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4.9	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.9	□□□□□ -1.62
USP7-217	ENST00000567329	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		K7EQD1	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		Q9HAA7	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		A0A087WYN8	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	NDUFC1	O43677	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	SLPI	P03973	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	XCL1	P47992	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	CCL18	P55774	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		H3BUX3	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	LECT2	O14960	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	PDE6G	P18545	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	BLCAP	P62952	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	SS18	Q15532	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		A0A087WZ39	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		H7BZZ5	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	INS	P01308	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	PFN2	P35080	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		Q9UF83	564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	ROS1	P08922	2347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	ATR	Q13535	2644 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		A0A087WVE0	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		A0A096LNT2	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP7-217	ENST00000567329		A0A0U1RRA0	63 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms