RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 PDE6GP18545 87 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 LINC00167Q96N53 147 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 AKAP6Q13023 2319 aa5.17□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 TENM4Q6N022 2769 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 COL12A1Q99715 3063 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 CXCL6P80162 114 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 BRK1Q8WUW1 75 aa5.16□□□□□ -1.58
PKP4-211ENST00000481115 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 KLLNB2CW77 178 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 M0R1B8 84 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 TRBV12-3P01733 135 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 CD28P10747 220 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 BSPH1Q075Z2 132 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 Q8N2B8 174 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.15□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 A0A0U1RQV1 116 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 A0A1W2PPR1 153 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 CRPP02741 224 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 DPM3Q9P2X0 92 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 SPG11Q96JI7 2443 aa5.14□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 CLPSL1A2RUU4 121 aa5.13□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.13□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 Q8N6K4 173 aa5.13□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 MUC4Q99102 2169 aa5.13□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 A0A087WVE0 104 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 E7EQL1 145 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 F6UB75 175 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 Q1T7F1 81 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 ESRGQ1W209 222 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 PRR9Q5T870 116 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.12□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 F8WEM9 126 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 APELAP0DMC3 54 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 FAM104AQ969W3 186 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.11□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.1□□□□□ -1.59
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PKP4-211ENST00000481115 LY6G6DO95868 133 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 MIFP14174 115 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 KRTAP10-9P60411 292 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 LCE1DQ5T752 114 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.1□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.09□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 ODF3BA8MYP8 253 aa5.09□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 GNRH2O43555 120 aa5.09□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 C15orf32Q32M92 178 aa5.09□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 CCL17Q92583 94 aa5.09□□□□□ -1.59
PKP4-211ENST00000481115 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.09□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 H3BUA1 57 aa5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ENHOQ6UWT2 76 aa5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 POLQO75417 2590 aa5.08□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 INAFM1C9JVW0 142 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SAA4P35542 130 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 C10orf25Q5T742 122 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CCL19Q99731 98 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 ZNF580Q9UK33 172 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 FBN2P35556 2912 aa5.07□□□□□ -1.6
PKP4-211ENST00000481115 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.06□□□□□ -1.6
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