RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 TMEM258P61165 79 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.07□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 VPS13CQ709C8 3753 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2D-28P01615 120 aa7.06□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.05□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 KLRB1Q12918 225 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 LINC00167Q96N53 147 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 KNCNA6PVL3 124 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 SERP2Q8N6R1 65 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 MED13LQ71F56 2210 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.04□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 DPH3Q96FX2 82 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 Q96MF0 132 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WYN8 130 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 LY6G6DO95868 133 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.03□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 hADV29S1A0JD25 119 aa7.02□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.02□□□□□ -1.28
HCG18-242ENST00000602319 H0YGX0 51 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 SYNJ2BPP57105 145 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 Q9HAA7 133 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 SS18Q15532 418 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 LINC00846Q9NV44 126 aa7.02□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 OXTP01178 125 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 CRPP02741 224 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 PRM2P04554 102 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 ZNF292O60281 2723 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.01□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 DNAL4O96015 105 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 NBL1P41271 181 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 UBE2E2Q96LR5 201 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1BQ00975 2339 aa7□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 DEFB131AP59861 70 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 EPM2AB3EWF7 344 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 K7EQD1 137 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 CEP250Q9BV73 2442 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 MSMBP08118 114 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 COX7B2Q8TF08 81 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 A0A0U1RRA0 63 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 AVPP01185 164 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 INSP01308 110 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 UCNP55089 124 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 ATP5J2P56134 94 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 Q5XG85 94 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 USP17L23D6RBM5 183 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 CCKP06307 115 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.98□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 CCL18P55774 89 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 C19orf84I3L1E1 186 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 ZNF702PQ9H963 129 aa6.97□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-59P01825 116 aa6.96□□□□□ -1.29
HCG18-242ENST00000602319 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.96□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 HTN1P15515 57 aa6.96□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.96□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WVE0 104 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 BCE1O60756 84 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.95□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 NCR3O14931 201 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 NDUFC2O95298 119 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 ACACAQ13085 2346 aa6.94□□□□□ -1.3
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PRX2 142 aa6.93□□□□□ -1.3
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