RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	MYO7A	Q13402	2215 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	GNGT2	O14610	69 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	RBP2	P50120	134 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	UBE2D3	P61077	147 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	UBE2D2	P62837	147 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	PMCHL1	Q16048	86 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	LAMB1	P07942	1786 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	CAD	P27708	2225 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	KMT2D	O14686	5537 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	PZP	P20742	1482 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	ANK2	Q01484	3957 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	ABCA1	O95477	2261 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	C10orf142	B7Z368	130 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173		H3BQF6	201 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	ATOX1	O00244	68 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	BCE1	O60756	84 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	MPC2	O95563	127 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	S100A10	P60903	97 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	PSMG4	Q5JS54	123 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	C14orf144	Q96I85	54 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	DPY30	Q9C005	99 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	LINC00846	Q9NV44	126 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173		U3KQA8	63 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		0.22	□□□□□ -2.37
CCNL1-223	ENST00000481173	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CACNA1E	Q15878	2313 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		M0R143	59 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	S100A8	P05109	93 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	UQCRH	P07919	91 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	COX8A	P10176	69 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SMIM11A	P58511	58 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	WFDC2	Q14508	124 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	HMGN3	Q15651	99 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SFTA2	Q6UW10	78 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	USMG5	Q96IX5	58 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	F5	P12259	2224 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF292	O60281	2723 aa		0.21	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PLXNA2	O75051	1894 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM223B	A6NKX1	122 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SPINK4	O60575	86 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	COX6B1	P14854	86 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	GNGT1	P63211	74 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173		Q5VSD8	79 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	LINC01600	Q96MT4	127 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TRGV9	Q99603	122 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		0.2	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
CCNL1-223	ENST00000481173	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38

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