RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PATE2Q6UY27 113 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-48P01763 117 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM141Q96I45 108 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 TACC2O95359 2948 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 F8VRH5 84 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 HCP5Q6MZN7 132 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 ENHOQ6UWT2 76 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 PKD1L2Q7Z442 2459 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF32P17041 273 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6HO94772 140 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 CUBNO60494 3623 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QKU1 62 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 CRIP1P50238 77 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf128Q5T292 105 aa4.85□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 hDV103S1A0JD37 113 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 F5H697 171 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 RIGQ13278 110 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK15Q9H2R5 256 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV2-11P01706 119 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 Q0VFX4 171 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM27BQ5VT28 67 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFC1O43677 76 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 COX6CP09669 75 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.84□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF580Q9UK33 172 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.83□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 CD28P10747 220 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 LYZP61626 148 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 COL12A1Q99715 3063 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01546A6NGU7 62 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 Q9HAA7 133 aa4.81□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 GYPEP15421 78 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf49Q96NF6 230 aa4.79□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.79□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF826PQ6ZT77 177 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf86A6NJI1 115 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 HTN1P15515 57 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-202ENST00000380828 LEAP2Q969E1 77 aa4.78□□□□□ -1.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 IGIPA6NJ69 53 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-202ENST00000380828 CXCL6P80162 114 aa4.77□□□□□ -1.65
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