RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 UBE2G1P62253 170 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PFDN5Q99471 154 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 TPT1P8Q9HAU6 139 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 RPRMQ9NS64 109 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 LAMA1P25391 3075 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PI4KAP42356 2102 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 MYH7P12883 1935 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CENPEQ02224 2701 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 IL5P05113 134 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PIPP12273 146 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 EDDM3BP56851 147 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNRGQ8N5I3 272 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 TCEAL4Q96EI5 215 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 DPH3Q96FX2 82 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SPTBN2O15020 2390 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 MYH8P13535 1937 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.11□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ACACAQ13085 2346 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC37A3O60309 1634 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 LRP6O75581 1613 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 HTTP42858 3142 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFA2O43678 99 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SNCGO76070 127 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFB6O95139 128 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 IFNA17P01571 189 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ACYP2P14621 99 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CBLN1P23435 193 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SELENOWP63302 87 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 S100A12P80511 92 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 INSL4Q14641 139 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC58Q4VC31 144 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 Q6ZRX8 168 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SPTSSAQ969W0 71 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 WFDC6Q9BQY6 131 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00846Q9NV44 126 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC167Q9P0B6 97 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 U3KQA8 63 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ASXL3Q9C0F0 2248 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 MGAQ8IWI9 3026 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 GOLGA3Q08378 1498 aa0.1□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ALKQ9UM73 1620 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 STARD9Q9P2P6 4700 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS13CQ709C8 3753 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SPEF2Q9C093 1822 aa0.09□□□□□ -2.39
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM14DPA8MWL7 114 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 NMBP08949 121 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ARPC4P59998 168 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 Q5VV11 94 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SPTSSBQ8NFR3 76 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SEC11CQ9BY50 192 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PLCE1Q9P212 2302 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 MAGI2Q86UL8 1455 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 FAT1Q14517 4588 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 TOP2BQ02880 1626 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PAPPAQ13219 1627 aa0.09□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 CLASP1Q7Z460 1538 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 KMT2AQ03164 3969 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 GNG7O60262 68 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 HMGN1P05114 100 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 IFITM1P13164 125 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 CCL8P80075 99 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 MEIG1Q5JSS6 88 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00470Q9BZP3 86 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00312Q9Y6C7 94 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PXDNQ92626 1479 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 IFT140Q96RY7 1462 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PLXNB2O15031 1838 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 FOCADQ5VW36 1801 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 FRYLO94915 3013 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa0.08□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 NWD2Q9ULI1 1742 aa0.07□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 KNL1Q8NG31 2342 aa0.07□□□□□ -2.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 177.9 ms