RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W UTR2P32623 467 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HSM3P38348 480 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TIF34P40217 347 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FIG4P42837 879 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W EPL1P43572 832 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PMT4P46971 762 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MNN10P50108 393 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W LYS5P50113 272 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MKC7P53379 596 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RSC4Q02206 625 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W UME1Q03010 460 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YLR352WQ06479 807 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MRL1Q06815 381 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MPC54Q08550 464 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MNE1P24720 663 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GCG1P32656 232 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PGM1P33401 570 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PBY1P38254 753 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W WAR1Q03631 944 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RCF1Q03713 159 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SUC2P00724 532 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HSC82P15108 705 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MSS116P15424 664 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SFA1P32771 386 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RRM3P38766 723 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TVP23P38962 199 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YTA6P40328 754 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PHM6Q05637 104 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GIC2Q06648 383 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ISU2Q12056 156 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GEP5Q12393 293 aa3.05□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SST2P11972 698 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ISW1P38144 1129 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SHU2P38957 223 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HXT8P40886 569 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SEC63P14906 663 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MSH3P25336 1018 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HEL1P36113 551 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W LAM1P38851 1228 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FTR1P40088 404 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W IRR1P40541 1150 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W STR2P47164 639 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
SIN3YOL004W ARP7Q12406 477 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GAL80P04387 435 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RIP1P08067 215 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W ALA1P40825 983 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W INA17Q02888 182 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YML096WQ04489 525 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W OPY2Q06810 360 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92 RIP-Chip
SIN3YOL004W MSF1P08425 469 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TAF13P11747 167 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W LAT1P12695 482 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YBR197CP38306 217 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RPC17P47076 161 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YPL113CQ02961 396 aa3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.04□□□□□ -1.92not detected
SIN3YOL004W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W KIP1P28742 1111 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W MTO1P53070 669 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SPC105P53148 917 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W GRC3Q07845 632 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RGT2Q12300 763 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FKS3Q04952 1785 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SCD5P34758 872 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YBR184WP38299 523 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RTT107P38850 1070 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W SOL3P38858 249 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W IKS1P47042 667 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W OMS1Q06668 471 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FMP25Q08023 583 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W COX2P00410 251 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W IMP2'P32351 346 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W HIR2P32480 875 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CUL3P53202 744 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W YDR262WQ12331 272 aa3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SIN3YOL004W FOB1O13329 566 aa3.02□□□□□ -1.93
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