RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN4	YMR138W	YJR079W	P47126	109 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	ATH1	P48016	1211 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	COQ6	P53318	479 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	YPR003C	P53394	754 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	SEG1	Q04279	960 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	NUR1	Q12066	484 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	IMA3	P0CW40	589 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	IMA4	P0CW41	589 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	KIN3	P22209	435 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	TSR4	P25040	408 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	AIM26	P32858	118 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	SRP101	P32916	621 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	COY1	P34237	679 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	BIT2	P38346	545 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	NEM1	P38757	446 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	PPE1	P38796	400 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	DUN1	P39009	513 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	HEM14	P40012	539 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	GYP8	P43570	497 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	BET4	Q00618	327 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	IMA2	Q08295	589 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	NRT1	Q08485	598 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	YLL056C	Q12177	298 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	MPD2	Q99316	277 aa		6.1	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	SIR1	P21691	654 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	ADY2	P25613	283 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	KAR9	P32526	644 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	APM3	P38153	483 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	EXO1	P39875	702 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	YEL028W	P39989	153 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	ALY2	P47029	1046 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	IML2	P47031	731 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	MET14	Q02196	202 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	YMR206W	Q03695	313 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	ATG23	Q06671	453 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	IRC10	Q08118	586 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	NDD1	Q08887	554 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CIN4	YMR138W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	GCR1	P07261	785 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPO26	P20435	155 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SWE1	P32944	819 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CKB2	P38930	258 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	STL1	P39932	569 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YAT2	P40017	923 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ELO3	P40319	345 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YNL320W	P42840	284 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RGD2	P43556	714 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	BST1	P43571	1029 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RMD8	P43620	662 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.08	□□□□□ -1.44	not detected
CIN4	YMR138W	IPI3	P53877	555 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SFB2	P53953	876 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPN4	Q03465	531 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	NSE1	Q07913	336 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.08	□□□□□ -1.44	not detected
CIN4	YMR138W	CDC8	P00572	216 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	GPI10	P30777	616 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	PLC1	P32383	869 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	KTR4	P38131	464 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	VHC1	P38329	1120 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	POP4	P38336	279 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ARP1	P38696	384 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ATM1	P40416	690 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	CHS6	P40955	746 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	SAE2	P46946	345 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	FLC3	P53121	802 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	GND2	P53319	492 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	NMA111	P53920	997 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	ADI1	Q03677	179 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CIN4	YMR138W	YHM2	Q04013	314 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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