RNA–Protein interactions for RNA: YMR007W

YMR007W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR007W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR007WYMR007W YFT2Q06676 274 aa8.4□□□□□ -1.06
YMR007WYMR007W THI21Q08975 551 aa8.4□□□□□ -1.06
YMR007WYMR007W BI3Q9ZZW7 517 aa8.4□□□□□ -1.06
YMR007WYMR007W CSF1Q12150 2958 aa8.4□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MIS1P09440 975 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SST2P11972 698 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SPT15P13393 240 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SPC110P32380 944 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PDR3P33200 976 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W FUI1P38196 639 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MUM2P38236 366 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YJL070CP40361 888 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TMA108P40462 946 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YIL054WP40524 105 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YNL108CP53929 270 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ELP3Q02908 557 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ERV41Q04651 352 aa8.39□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ADY2P25613 283 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YKL151CP36059 337 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W JNM1P36224 373 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ERV46P39727 415 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RVS167P39743 482 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YCK3P39962 524 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W LTP1P40347 161 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SNG1P46950 547 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W CSN12P47130 423 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W AMA1P50082 593 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YGL140CP53120 1219 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W COG7P53195 279 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ORC3P54790 616 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W INA17Q02888 182 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YPL113CQ02961 396 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PIR1Q03178 341 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TMA16Q08687 178 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SFI1Q12369 946 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PEX11Q12462 236 aa8.38□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MTF2P10849 440 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W EST1P17214 699 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data8.37□□□□□ -1.07not detected
YMR007WYMR007W SFP1P32432 683 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W APM3P38153 483 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PSY4P38193 441 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SWC5P38326 303 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YER158CP40095 573 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ASG1P40467 964 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YGR111WP53265 400 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W INP2Q03824 705 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YLR287CQ05881 355 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YLR456WQ06199 204 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W NAG1Q8TGN9 163 aa8.37□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W UBR1P19812 1950 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RRP3P38712 501 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W UME6P39001 836 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W KTR7P40504 517 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W FET5P43561 622 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MNN11P46985 422 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YJL132WP47014 750 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SWS2P53937 143 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W BET4Q00618 327 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TRM82Q03774 444 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YDR222WQ04925 415 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W Q0182Q9ZZW1 134 aa8.36□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TUP1P16649 713 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MRPL8P22353 238 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SEC65P29478 273 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RPN12P32496 274 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W KAR9P32526 644 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SLD2P34252 453 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TMN3P40071 706 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RAD26P40352 1085 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MMM1P41800 426 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SUM1P46676 1062 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W EMC4P53073 190 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W ALR1Q08269 859 aa8.35□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SUC2P00724 532 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TRX1P22217 103 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MNE1P24720 663 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W WBP1P33767 430 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YKL050CP35736 922 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YHL041WP38730 149 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W VFA1P40080 203 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W RRN7P40992 514 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W YJR124CP47159 448 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TCB2P48231 1178 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W MNT2P53059 558 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W TAD1P53065 400 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SUN4P53616 420 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W SNO2P53823 222 aa8.34□□□□□ -1.07
YMR007WYMR007W PPN1Q04119 674 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.5 ms