RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	PHO8	P11491	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	CKI1	P20485	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	DAL7	P21826	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	AFR1	P33304	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	ATG19	P35193	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	JNM1	P36224	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	YER158C	P40095	573 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	FIS1	P40515	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	EFM4	P40516	257 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	CRD1	Q07560	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	RAD57	P25301	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	MRP8	P35719	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	UBP11	P36026	717 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	BYE1	P36106	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	BUD16	P39988	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	NET1	P47035	1189 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	SGM1	P47166	707 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	EXG2	P52911	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	MLH2	Q07980	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	UTR4	P32626	227 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	YSC83	P32792	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	SDS3	P40505	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	NCS6	P53088	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	BOP3	P53958	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	SOV1	Q04748	898 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	DAS2	Q12084	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	NPC2	Q12408	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LAS1	YKR063C	RPO26	P20435	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	HXT1	P32465	570 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	CNS1	P33313	385 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	SHP1	P34223	423 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	REG2	P38232	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YBR184W	P38299	523 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	TIM8	P57744	87 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	DON1	Q05610	365 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	ATG23	Q06671	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YLR001C	Q07895	862 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	LAS17	Q12446	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	TUP1	P16649	713 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
LAS1	YKR063C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	NFU1	P32860	256 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YEL1	P34225	687 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	TVP38	P36164	337 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	SMF1	P38925	575 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	IRR1	P40541	1150 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YGR021W	P53212	290 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	MDR1	P53258	950 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	ESBP6	P53918	673 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	ARK1	P53974	638 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	NGL3	Q03210	505 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	AIM39	Q08223	395 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	CDC8	P00572	216 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	EUG1	P32474	517 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	COT1	P32798	439 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YRO2	P38079	344 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YIL089W	P40500	205 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	LCB2	P40970	561 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	PFD1	P46988	109 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	TAD1	P53065	400 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	JJJ1	P53863	590 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LAS1	YKR063C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms