RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	YIG1	Q08956	461 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ARP7	Q12406	477 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SEC39	Q12745	709 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CDC16	P09798	840 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	KRE2	P27809	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	DAL3	P32459	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	VPS17	P32913	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PPQ1	P32945	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	COY1	P34237	679 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	UME6	P39001	836 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SKP2	P42843	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	EPL1	P43572	832 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ASK10	P48361	1146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MON1	P53129	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YNR061C	P53747	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CBK1	P53894	756 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ARP5	P53946	755 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PNG1	Q02890	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MGR3	Q04472	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MFB1	Q04922	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HDA2	Q06629	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GRX6	Q12438	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GCN4	P03069	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	BI4	P03879	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	KSS1	P14681	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	STE50	P25344	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ADP1	P25371	1049 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GPI10	P30777	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MLS1	P30952	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ERG3	P32353	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MRE11	P32829	692 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MRP4	P32902	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YBR284W	P38150	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YBR225W	P38321	900 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SPL2	P38839	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RTS1	P38903	757 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SAW1	P39735	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FMP10	P40098	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	IMA5	P40884	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GYP8	P43570	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NCS6	P53088	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NUT1	P53114	1132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
KTR2	YKR061W	MDY2	Q12285	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FRE6	Q12473	712 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NUC1	P08466	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PUT4	P15380	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HOP1	P20050	605 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CBP3	P21560	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PRE8	P23639	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ROX1	P25042	368 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MGM1	P32266	881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SPC110	P32380	944 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CBF2	P32504	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PET10	P36139	283 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	TDA3	P38758	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PEX28	P38848	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MBP1	P39678	833 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	BUD16	P39988	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LCB2	P40970	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PXA1	P41909	870 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CAF16	P43569	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RAD17	P48581	401 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HLR1	Q04429	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PMT7	Q06644	662 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CDA2	Q06703	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.9 ms