RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	JNM1	P36224	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	SMF1	P38925	575 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	MNN1	P39106	762 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	NPP2	P39997	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	FIS1	P40515	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	NGL3	Q03210	505 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	RPN4	Q03465	531 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	PHM6	Q05637	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	OPY2	Q06810	360 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	CRD1	Q07560	283 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	GUD1	Q07729	489 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	PCK1	P10963	549 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	PER1	P25625	357 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	SRB4	P32569	687 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	UTR4	P32626	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	BUD16	P39988	312 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	PEA2	P40091	420 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	AIM21	P40563	679 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	LCB2	P40970	561 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	SHE9	Q04172	456 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	MLH2	Q07980	695 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LOH1	YJL038C	ERG11	P10614	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	PHO8	P11491	566 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RPO26	P20435	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CKI1	P20485	582 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	HXT1	P32465	570 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MCD4	P36051	919 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	UBP13	P38187	747 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YJR142W	P47173	342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MAL13	P53338	473 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ATG23	Q06671	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	DAS2	Q12084	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ERP3	Q12403	225 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ADE8	P04161	214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SWI6	P09959	803 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	KAR1	P11927	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YEL043W	P32618	956 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YSC83	P32792	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ATG19	P35193	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	BYE1	P36106	594 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	REG2	P38232	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CIN4	P39110	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	VAB2	P40003	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YER158C	P40095	573 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SMC3	P47037	1230 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	VID30	P53076	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TAM41	P53230	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TIM8	P57744	87 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SLD5	Q03406	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CUR1	Q06469	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	AIM39	Q08223	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SLX4	Q12098	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	NPC2	Q12408	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	ECM29	P38737	1868 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	GAL11	P19659	1081 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CDC11	P32458	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MRP8	P35719	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	MSS4	P38994	779 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	SDS3	P40505	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
LOH1	YJL038C	EXG2	P52911	562 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	HUL5	P53119	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	BTN2	P53286	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	GYL1	Q04322	720 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	RMP1	Q12530	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LOH1	YJL038C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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