RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D VTH1P40438 1549 aa5.06□□□□□ -1.6
tK(UUU)DtK(UUU)D VTH2P40890 1549 aa5.06□□□□□ -1.6
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS15P22219 1454 aa5.05□□□□□ -1.6
tK(UUU)DtK(UUU)D BNI1P41832 1953 aa5.04□□□□□ -1.6
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-ER2Q03619 1755 aa5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-MR1Q04214 1755 aa5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-NL1Q12112 1755 aa5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-GR1Q12141 1755 aa5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-BLQ12490 1755 aa5.02□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D YRF1-1P0CX20 1796 aa5.01□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D YRF1-5P0CX21 1796 aa5.01□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D YRF1-8P0CX22 1796 aa5.01□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D IFH1P39520 1085 aa5.01□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D YFR006WP43590 535 aa5.01□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D URN1Q06525 465 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D RPO21P04050 1733 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D NTE1Q04958 1679 aa4.97□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D NUP157P40064 1391 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D BUD3P25558 1636 aa4.97□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D NUP170P38181 1502 aa4.97□□□□□ -1.61
tK(UUU)DtK(UUU)D PDR12Q02785 1511 aa4.96□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D CKB1P43639 278 aa4.95□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D IQG1Q12280 1495 aa4.94□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D YAP3P38749 330 aa4.94□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D PDR10P51533 1564 aa4.93□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D TRM3Q07527 1436 aa4.93□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D CAT8P39113 1433 aa4.92□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D ULS1Q08562 1619 aa4.92□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D SPO14P36126 1683 aa4.9□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D MLP2P40457 1679 aa4.9□□□□□ -1.62
tK(UUU)DtK(UUU)D BNR1P40450 1375 aa4.89□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D GDB1Q06625 1536 aa4.88□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D SEC7P11075 2009 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D MAK10Q02197 733 aa4.86□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D DNF2Q12675 1612 aa4.86□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D DOP1Q03921 1698 aa4.85□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D IRC20Q06554 1556 aa4.84□□□□□ -1.63
tK(UUU)DtK(UUU)D IPL1P38991 367 aa4.83□□□□□ -1.64
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR196WQ04336 1088 aa4.83□□□□□ -1.64
tK(UUU)DtK(UUU)D YSP2Q06681 1438 aa4.82□□□□□ -1.64
tK(UUU)DtK(UUU)D SRB8P25648 1427 aa4.81□□□□□ -1.64
tK(UUU)DtK(UUU)D ARO1P08566 1588 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D TY3B-GQ99315 1547 aa4.77□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D YOR093CQ12275 1648 aa4.75□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D PAF1P38351 445 aa4.74□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D CHC1P22137 1653 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D TYS1P36421 394 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
tK(UUU)DtK(UUU)D YBT1P32386 1661 aa4.71□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D MRX12P47084 519 aa4.71□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D HAP1P0CE41 1502 aa4.71□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D THI12P42883 340 aa4.7□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D THI5P43534 340 aa4.7□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D THI11P47183 340 aa4.7□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D THI13Q07748 340 aa4.7□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D DNF3Q12674 1656 aa4.7□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D NAP1P25293 417 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D BFR2Q06631 534 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
tK(UUU)DtK(UUU)D SCT1P32784 759 aa4.65□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D YAH1Q12184 172 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D ALD4P46367 519 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D NOP7P53261 605 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D RIA1P53893 1110 aa4.64□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D SSM4P40318 1319 aa4.63□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D NUP188P52593 1655 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D ESL2P36168 1195 aa4.62□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D VMR1P38735 1592 aa4.61□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D YNR029CP53729 429 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D PDR5P33302 1511 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D RTC1Q08281 1341 aa4.6□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D PTP3P40048 928 aa4.59□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D RAV1P47104 1357 aa4.59□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D IML1P47170 1584 aa4.59□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D CAB1Q04430 367 aa4.59□□□□□ -1.67
tK(UUU)DtK(UUU)D USO1P25386 1790 aa4.58□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D KRE5P22023 1365 aa4.57□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D YIL055CP40523 627 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D GCN2P15442 1659 aa4.56□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF5P38129 798 aa4.55□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D ENT1Q12518 454 aa4.55□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D PDR11P40550 1411 aa4.55□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D PRI1P10363 409 aa4.54□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D GLN1P32288 370 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D APP1P53933 587 aa4.54□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF8Q03750 510 aa4.54□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D BCK1Q01389 1478 aa4.54□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD9P14737 1309 aa4.53□□□□□ -1.68
tK(UUU)DtK(UUU)D CPS1P27614 576 aa4.52□□□□□ -1.69
tK(UUU)DtK(UUU)D PRP45P28004 379 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
tK(UUU)DtK(UUU)D ENV9Q08651 330 aa4.52□□□□□ -1.69
tK(UUU)DtK(UUU)D LEU3P08638 886 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.3 ms