RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	DNF2	Q12675	1612 aa		7.69	□□□□□ -1.18
YNL057W	YNL057W	SPP41	P38904	1435 aa		7.68	□□□□□ -1.18
YNL057W	YNL057W	NTE1	Q04958	1679 aa		7.66	□□□□□ -1.18
YNL057W	YNL057W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
YNL057W	YNL057W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		7.64	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	POL1	P13382	1468 aa		7.63	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	SMC4	Q12267	1418 aa		7.63	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	YOR1	P53049	1477 aa		7.62	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	TSC11	P40061	1430 aa		7.61	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	VTH1	P40438	1549 aa		7.61	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	VTH2	P40890	1549 aa		7.61	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	STU1	P38198	1513 aa		7.6	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	NUP170	P38181	1502 aa		7.59	□□□□□ -1.19
YNL057W	YNL057W	YOR093C	Q12275	1648 aa		7.56	□□□□□ -1.2
YNL057W	YNL057W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
YNL057W	YNL057W	SNT2	P53127	1403 aa		7.52	□□□□□ -1.2
YNL057W	YNL057W	DOP1	Q03921	1698 aa		7.52	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	SPO14	P36126	1683 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	MYO4	P32492	1471 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	ULS1	Q08562	1619 aa		7.51	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	MET10	P39692	1035 aa		7.5	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
YNL057W	YNL057W	RTT106	P40161	455 aa		7.43	□□□□□ -1.22
YNL057W	YNL057W	TRM3	Q07527	1436 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YNL057W	YNL057W	PDR10	P51533	1564 aa		7.42	□□□□□ -1.22
YNL057W	YNL057W	IQG1	Q12280	1495 aa		7.41	□□□□□ -1.22
YNL057W	YNL057W	PDR12	Q02785	1511 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YNL057W	YNL057W	STH1	P32597	1359 aa		7.39	□□□□□ -1.23
YNL057W	YNL057W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
YNL057W	YNL057W	YTA7	P40340	1379 aa		7.37	□□□□□ -1.23
YNL057W	YNL057W	GDB1	Q06625	1536 aa		7.36	□□□□□ -1.23
YNL057W	YNL057W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
YNL057W	YNL057W	DNF3	Q12674	1656 aa		7.31	□□□□□ -1.24
YNL057W	YNL057W	BUD3	P25558	1636 aa		7.3	□□□□□ -1.24
YNL057W	YNL057W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
YNL057W	YNL057W	MLP2	P40457	1679 aa		7.28	□□□□□ -1.24
YNL057W	YNL057W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
YNL057W	YNL057W	MRPL32	P25348	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
YNL057W	YNL057W	YAP3	P38749	330 aa		7.23	□□□□□ -1.25
YNL057W	YNL057W	MAK10	Q02197	733 aa		7.22	□□□□□ -1.25
YNL057W	YNL057W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		7.17	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	AVT3	P36062	692 aa		7.17	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	BNR1	P40450	1375 aa		7.17	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	YSP2	Q06681	1438 aa		7.17	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	USO1	P25386	1790 aa		7.16	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	IFH1	P39520	1085 aa		7.15	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
YNL057W	YNL057W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
YNL057W	YNL057W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YNL057W	YNL057W	REB1	P21538	810 aa		7.12	□□□□□ -1.27
YNL057W	YNL057W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
YNL057W	YNL057W	CKB1	P43639	278 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YNL057W	YNL057W	THI12	P42883	340 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	THI5	P43534	340 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	THI11	P47183	340 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	THI13	Q07748	340 aa		7.08	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	CAT8	P39113	1433 aa		7.07	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	YMR196W	Q04336	1088 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	TAF7	Q05021	590 aa		7.04	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	YGL015C	P33199	130 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	YBT1	P32386	1661 aa		7.03	□□□□□ -1.28
YNL057W	YNL057W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
YNL057W	YNL057W	IML1	P47170	1584 aa		6.99	□□□□□ -1.29
YNL057W	YNL057W	IPL1	P38991	367 aa		6.98	□□□□□ -1.29
YNL057W	YNL057W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
YNL057W	YNL057W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	HAP1	P0CE41	1502 aa		6.96	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	APP1	P53933	587 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	VMR1	P38735	1592 aa		6.93	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
YNL057W	YNL057W	SRB8	P25648	1427 aa		6.86	□□□□□ -1.31
YNL057W	YNL057W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
YNL057W	YNL057W	CDC27	P38042	758 aa		6.85	□□□□□ -1.31
YNL057W	YNL057W	PTP3	P40048	928 aa		6.83	□□□□□ -1.32
YNL057W	YNL057W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
YNL057W	YNL057W	YMR074C	Q04773	145 aa		6.81	□□□□□ -1.32
YNL057W	YNL057W	SPT21	P35209	758 aa		6.8	□□□□□ -1.32
YNL057W	YNL057W	KRE5	P22023	1365 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YNL057W	YNL057W	BCK1	Q01389	1478 aa		6.78	□□□□□ -1.32
YNL057W	YNL057W	PDR11	P40550	1411 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	6.77	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	RIA1	P53893	1110 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	ENT1	Q12518	454 aa		6.76	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	MRX12	P47084	519 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	ENV9	Q08651	330 aa		6.74	□□□□□ -1.33
YNL057W	YNL057W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms