RNA–Protein interactions for RNA: YJL135W

YJL135W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL135W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL135W	YJL135W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	YEL023C	P39992	682 aa		6.34	□□□□□ -1.39
YJL135W	YJL135W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.33	□□□□□ -1.4	not detected
YJL135W	YJL135W	DCW1	P36091	449 aa		6.3	□□□□□ -1.4
YJL135W	YJL135W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
YJL135W	YJL135W	RGA1	P39083	1007 aa		6.27	□□□□□ -1.41
YJL135W	YJL135W	TFA1	P36100	482 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YJL135W	YJL135W	CST9	Q06032	482 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YJL135W	YJL135W	SSP1	P38871	571 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YJL135W	YJL135W	PML39	Q03760	334 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YJL135W	YJL135W	YDR344C	Q05510	147 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YJL135W	YJL135W	MGA2	P40578	1113 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YJL135W	YJL135W	ARH1	P48360	493 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YJL135W	YJL135W	SRC1	Q03707	834 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YJL135W	YJL135W	RCR1	P38212	213 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YJL135W	YJL135W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
YJL135W	YJL135W	SPT23	P35210	1082 aa		6.13	□□□□□ -1.43
YJL135W	YJL135W	GUT1	P32190	709 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	PEX29	Q03370	554 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	MID1	P41821	548 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	ATH1	P48016	1211 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	BNI4	P53858	892 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	HAP5	Q02516	242 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
YJL135W	YJL135W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
YJL135W	YJL135W	NST1	P53935	1240 aa		6	□□□□□ -1.45
YJL135W	YJL135W	AI4	P03878	556 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YJL135W	YJL135W	MPH3	P0CE00	602 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YJL135W	YJL135W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YJL135W	YJL135W	MIF2	P35201	549 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YJL135W	YJL135W	RAS1	P01119	309 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YJL135W	YJL135W	TRK1	P12685	1235 aa		5.92	□□□□□ -1.46
YJL135W	YJL135W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
YJL135W	YJL135W	EDS1	P38073	919 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YJL135W	YJL135W	SOL3	P38858	249 aa		5.91	□□□□□ -1.46
YJL135W	YJL135W	MPC54	Q08550	464 aa		5.9	□□□□□ -1.46
YJL135W	YJL135W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YJL135W	YJL135W	NMA111	P53920	997 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YJL135W	YJL135W	AMS1	P22855	1083 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YJL135W	YJL135W	YPL062W	Q02781	134 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YJL135W	YJL135W	COQ8	P27697	501 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YJL135W	YJL135W	DPL1	Q05567	589 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YJL135W	YJL135W	YGR273C	P53329	174 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YJL135W	YJL135W	YPR015C	Q12531	247 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YJL135W	YJL135W	RAM2	P29703	316 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YJL135W	YJL135W	GYP1	Q08484	637 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YJL135W	YJL135W	RAM1	P22007	431 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YJL135W	YJL135W	SLI15	P38283	698 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YJL135W	YJL135W	SAS4	Q04003	481 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YJL135W	YJL135W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YJL135W	YJL135W	ISU2	Q12056	156 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YJL135W	YJL135W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YJL135W	YJL135W	SDH2	P21801	266 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YJL135W	YJL135W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
YJL135W	YJL135W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.65	□□□□□ -1.5	not detected
YJL135W	YJL135W	BRE2	P43132	505 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YJL135W	YJL135W	GCR2	Q01722	534 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YJL135W	YJL135W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YJL135W	YJL135W	KEX1	P09620	729 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJL135W	YJL135W	PDR1	P12383	1068 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJL135W	YJL135W	CDC73	Q06697	393 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YJL135W	YJL135W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
YJL135W	YJL135W	ERG12	P07277	443 aa		5.54	□□□□□ -1.52
YJL135W	YJL135W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YJL135W	YJL135W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YJL135W	YJL135W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
YJL135W	YJL135W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YJL135W	YJL135W	ENV9	Q08651	330 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YJL135W	YJL135W	MET22	P32179	357 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	CST6	P40535	587 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	CDC4	P07834	779 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	CLA4	P48562	842 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	RAD54	P32863	898 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.44	□□□□□ -1.54	not detected
YJL135W	YJL135W	LAM6	Q08001	693 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	STR2	P47164	639 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	YRR1	Q12172	810 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	VHR2	P40041	505 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	PEX21	P50091	288 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	ISM1	P48526	1002 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	YDR444W	Q04093	687 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YJL135W	YJL135W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	TFB4	Q12004	338 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	NUD1	P32336	851 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	NPL4	P33755	580 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	HED1	Q03937	162 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	CSC1	Q06538	782 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	YDL176W	Q12027	708 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YJL135W	YJL135W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	BDP1	P46678	594 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		5.31	□□□□□ -1.56
YJL135W	YJL135W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		5.31	□□□□□ -1.56

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