RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627189.2

PCBP1-AS1-311, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 740 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.26□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TOPBP1Q92547 1522 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 POLA2Q14181 598 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SPOCK2Q92563 424 aa10.21□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ERCC6Q03468 1493 aa10.21□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.21□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 WDR97A6NE52 1622 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 WDR62O43379 1518 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TRIM41Q8WV44 630 aa10.17□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa10.15□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 KLHL34Q8N239 644 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.13□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CUX2O14529 1486 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SOGA1O94964 1423 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.09□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PBRM1Q86U86 1689 aa10.09□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TPRNQ4KMQ1 711 aa10.08□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CAPN15O75808 1086 aa10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CFAP44Q96MT7 982 aa10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 IFT140Q96RY7 1462 aa10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 RGL2O15211 777 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 RNF39Q9H2S5 420 aa10.02□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 EEA1Q15075 1411 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 KIF27Q86VH2 1401 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PLCD3Q8N3E9 789 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 KIF21BO75037 1637 aa10□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CUL7Q14999 1698 aa9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.98□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.98□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ADAMTS12P58397 1594 aa9.97□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SPDYE6P0CI01 402 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PRXQ9BXM0 1461 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 MIER1Q8N108 512 aa9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 GRIN2BQ13224 1484 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 IGF1RP08069 1367 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ABCB7O75027 752 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CHD1O14646 1710 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 GOLGA3Q08378 1498 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 PLEKHG5O94827 1062 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 NBR1Q14596 966 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SYNJ2O15056 1496 aa9.83□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 GRIN2AQ12879 1464 aa9.83□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CEP170Q5SW79 1584 aa9.83□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 OSCARQ8IYS5 282 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.79□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CEP162Q5TB80 1403 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 IQGAP2Q13576 1575 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 DSG3P32926 999 aa9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 NUP160Q12769 1436 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 GSE1Q14687 1217 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SAMD9Q5K651 1589 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 SHROOM2Q13796 1616 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 CLIP1P30622 1438 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ARAP1Q96P48 1450 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-311ENST00000627189 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms