RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-216ENST00000619023 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.4■□□□□ 0.06
AKAP9-216ENST00000619023 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.39■□□□□ 0.057e-7■■■■□ 23.2
AKAP9-216ENST00000619023 CUX2O14529 1486 aa15.39■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 MRS2Q9HD23 443 aa15.39■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 TMC1Q8TDI8 760 aa15.38■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.38■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 SMARCA4P51532 1647 aa15.37■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.36■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.36■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.35■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
AKAP9-216ENST00000619023 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.31■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 BCL11AQ9H165 835 aa15.31■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 SLC24A1O60721 1099 aa15.3■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.29■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.29■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.042e-7■□□□□ 9.8
AKAP9-216ENST00000619023 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.28■□□□□ 0.04
AKAP9-216ENST00000619023 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.27■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.25■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 ERCC6Q03468 1493 aa15.23■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 KCNH8Q96L42 1107 aa15.22■□□□□ 0.03
AKAP9-216ENST00000619023 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.17■□□□□ 0.02
AKAP9-216ENST00000619023 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.17■□□□□ 0.02
AKAP9-216ENST00000619023 RGL3Q3MIN7 710 aa15.16■□□□□ 0.02
AKAP9-216ENST00000619023 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.15■□□□□ 0.02
AKAP9-216ENST00000619023 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.15■□□□□ 0.02
AKAP9-216ENST00000619023 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.13■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 NBR1Q14596 966 aa15.12■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.12■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 FMN1Q68DA7 1419 aa15.1■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.09■□□□□ 0.01
AKAP9-216ENST00000619023 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.08■□□□□ 0
AKAP9-216ENST00000619023 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.07■□□□□ 0
AKAP9-216ENST00000619023 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.04■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.04■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 CDCA8Q53HL2 280 aa15.04■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.04■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 CCER2I3L3R5 266 aa15.04■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
AKAP9-216ENST00000619023 PPP4R2Q9NY27 417 aa15□□□□□ -0.01
AKAP9-216ENST00000619023 FOXD1Q16676 465 aa14.98□□□□□ -0.01
AKAP9-216ENST00000619023 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
AKAP9-216ENST00000619023 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.98□□□□□ -0.01
AKAP9-216ENST00000619023 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.98□□□□□ -0.01
AKAP9-216ENST00000619023 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.96□□□□□ -0.01
AKAP9-216ENST00000619023 CFAP53Q96M91 514 aa14.95□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.95□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.94□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.94□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.93□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 PKD2Q13563 968 aa14.92□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 TMF1P82094 1093 aa14.92□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 KIF21BO75037 1637 aa14.92□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 KANK1Q14678 1352 aa14.92□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.9□□□□□ -0.02
AKAP9-216ENST00000619023 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.88□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 BECN1Q14457 450 aa14.87□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.87□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.87□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 SYNJ1O43426 1573 aa14.85□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 NEUROD2Q15784 382 aa14.84□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 ARXQ96QS3 562 aa14.84□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 NUP155O75694 1391 aa14.84□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
AKAP9-216ENST00000619023 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.82□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.81□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 POGKQ9P215 609 aa14.81□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 NUDCQ9Y266 331 aa14.8□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.79□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 IGF1RP08069 1367 aa14.79□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.79□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 C14orf37Q86TY3 774 aa14.79□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.78□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
AKAP9-216ENST00000619023 CUX1P39880 1505 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms