RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 METRNQ9UJH8 293 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-204ENST00000577468 POTEMA6NI47 508 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHG5O94827 1062 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-204ENST00000577468 POTEGQ6S5H5 508 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-204ENST00000577468 KIF12Q96FN5 646 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-204ENST00000577468 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-204ENST00000577468 POTEJP0CG39 1038 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-204ENST00000577468 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-204ENST00000577468 MIER1Q8N108 512 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-204ENST00000577468 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-204ENST00000577468 TIE1P35590 1138 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-204ENST00000577468 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K13O43283 966 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 RASEFQ8IZ41 740 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 TRPC6Q9Y210 931 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 POTEFA5A3E0 1075 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 SEC24BO95487 1268 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 IER5LQ5T953 404 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 NUBP1P53384 320 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRM-204ENST00000577468 FAM212AQ96EL1 285 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRM-204ENST00000577468 IFNL1Q8IU54 200 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRM-204ENST00000577468 PLCG2P16885 1265 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-204ENST00000577468 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRM-204ENST00000577468 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRM-204ENST00000577468 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRM-204ENST00000577468 ST18O60284 1047 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 OCEL1Q9H607 264 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP8Q14318 412 aa8□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 SNPHO15079 494 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO3Q9UK99 471 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 PYGBP11216 843 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-204ENST00000577468 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRM-204ENST00000577468 GSE1Q14687 1217 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA2Q08379 1002 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL34Q8N239 644 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 MMRN1Q13201 1228 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 MARVELD3Q96A59 401 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRM-204ENST00000577468 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.166e-7■■■□□ 16.3
PTPRM-204ENST00000577468 PSEN1P49768 467 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRM-204ENST00000577468 EMP3P54852 163 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRM-204ENST00000577468 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-204ENST00000577468 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRM-204ENST00000577468 G3V3G9 751 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRM-204ENST00000577468 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRM-204ENST00000577468 FAM205CA6NFA0 338 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRM-204ENST00000577468 SPOCK2Q92563 424 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRM-204ENST00000577468 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRM-204ENST00000577468 POTEB3A0JP26 581 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 POTEBQ6S5H4 581 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 CABP2Q9NPB3 220 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 DOK7Q18PE1 504 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM41Q8WV44 630 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRM-204ENST00000577468 RIMBP2O15034 1052 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRM-204ENST00000577468 ERBB3P21860 1342 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRM-204ENST00000577468 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRM-204ENST00000577468 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-204ENST00000577468 SOX12O15370 315 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-204ENST00000577468 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-204ENST00000577468 MICALL2Q8IY33 904 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-204ENST00000577468 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 GPR153Q6NV75 609 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-204ENST00000577468 PTGER2P43116 358 aa7.5□□□□□ -1.21
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