RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 SLC39A7Q92504 469 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-232ENST00000552331 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-232ENST00000552331 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-232ENST00000552331 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CS-232ENST00000552331 PHF12Q96QT6 1004 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-232ENST00000552331 MMRN1Q13201 1228 aa7.34□□□□□ -1.23
CS-232ENST00000552331 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-232ENST00000552331 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-232ENST00000552331 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CS-232ENST00000552331 CREBZFQ9NS37 354 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-232ENST00000552331 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-232ENST00000552331 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-232ENST00000552331 POTEFA5A3E0 1075 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-232ENST00000552331 ST18O60284 1047 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-232ENST00000552331 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CS-232ENST00000552331 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CS-232ENST00000552331 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.13□□□□□ -1.27
CS-232ENST00000552331 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 SEC24BO95487 1268 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 TIE1P35590 1138 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-232ENST00000552331 FKBP8Q14318 412 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 TRPC6Q9Y210 931 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 KIF12Q96FN5 646 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 IER5LQ5T953 404 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 MARVELD3Q96A59 401 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-232ENST00000552331 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-232ENST00000552331 SNPHO15079 494 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-232ENST00000552331 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-232ENST00000552331 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-232ENST00000552331 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-232ENST00000552331 MAP3K13O43283 966 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-232ENST00000552331 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-232ENST00000552331 EMP3P54852 163 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-232ENST00000552331 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-232ENST00000552331 POTEB3A0JP26 581 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-232ENST00000552331 PLCG2P16885 1265 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-232ENST00000552331 POTEBQ6S5H4 581 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-232ENST00000552331 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 FAM205CA6NFA0 338 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 BCANQ96GW7 911 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-232ENST00000552331 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 OCEL1Q9H607 264 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 PLCB2Q00722 1185 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 ARXQ96QS3 562 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-232ENST00000552331 RASEFQ8IZ41 740 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-232ENST00000552331 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-232ENST00000552331 FBXO3Q9UK99 471 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-232ENST00000552331 IFNL1Q8IU54 200 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-232ENST00000552331 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-232ENST00000552331 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-232ENST00000552331 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-232ENST00000552331 PTGER2P43116 358 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-232ENST00000552331 ERBB3P21860 1342 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-232ENST00000552331 PLEKHG5O94827 1062 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-232ENST00000552331 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 HOMEZQ8IX15 550 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-232ENST00000552331 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 MIER1Q8N108 512 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 KLHL34Q8N239 644 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 PROM2Q8N271 834 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 NUBP1P53384 320 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 DOK7Q18PE1 504 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-232ENST00000552331 FAM212AQ96EL1 285 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 RIMBP2O15034 1052 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 GOLGA2Q08379 1002 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 HCSTQ9UBK5 93 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-232ENST00000552331 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.4□□□□□ -1.38
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