RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POTEFA5A3E0 1075 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMRN1Q13201 1228 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ST18O60284 1047 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIE1P35590 1138 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIF12Q96FN5 646 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEC24BO95487 1268 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRPC6Q9Y210 931 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IER5LQ5T953 404 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAP3K13O43283 966 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNPHO15079 494 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLCG2P16885 1265 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARVELD3Q96A59 401 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RASEFQ8IZ41 740 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLEKHG5O94827 1062 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EMP3P54852 163 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IFNL1Q8IU54 200 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PROM2Q8N271 834 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OCEL1Q9H607 264 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POTEB3A0JP26 581 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 POTEBQ6S5H4 581 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM205CA6NFA0 338 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MIER1Q8N108 512 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NUBP1P53384 320 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM212AQ96EL1 285 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-1333P-201ENST00000516162 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ERBB3P21860 1342 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PTGER2P43116 358 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA2Q08379 1002 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PYGBP11216 843 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DOK7Q18PE1 504 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 G3V3G9 751 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIMBP2O15034 1052 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PSEN1P49768 467 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR153Q6NV75 609 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSE1Q14687 1217 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HCSTQ9UBK5 93 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CABP2Q9NPB3 220 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PBX2P40425 430 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARSIQ5FYB1 569 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MICALL2Q8IY33 904 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RGS20O76081 388 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLHL34Q8N239 644 aa6.94□□□□□ -1.3
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