RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEB3A0JP26 581 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEBQ6S5H4 581 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARVELD3Q96A59 401 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-871P-201ENST00000516122 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 CREBZFQ9NS37 354 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBLN2P98095 1184 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPC6Q9Y210 931 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMP3P54852 163 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM205CA6NFA0 338 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC24BO95487 1268 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 TIE1P35590 1138 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNPHO15079 494 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNA4P22459 653 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYT1LQ9UL68 1186 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 IER5LQ5T953 404 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF12Q96FN5 646 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC61Q9Y6R9 512 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM35Q9UPQ4 493 aa4.76□□□□□ -1.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXD4L1Q9NU39 408 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP3K13O43283 966 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLCG2P16885 1265 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGER2P43116 358 aa4.65□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATXN8OSP0DMR3 200 aa4.64□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE2BO14633 110 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 STAG3Q9UJ98 1225 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-871P-201ENST00000516122 OCEL1Q9H607 264 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERBB3P21860 1342 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGS20O76081 388 aa4.56□□□□□ -1.68
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 HCSTQ9UBK5 93 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB22O15209 634 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZNB5 142 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3orf67Q6ZVT6 689 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFNL1Q8IU54 200 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASEFQ8IZ41 740 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFFO2Q5TF58 517 aa4.43□□□□□ -1.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0G2JS52 829 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOK7Q18PE1 504 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR153Q6NV75 609 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIMBP2O15034 1052 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 HRO43593 1189 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 PBX2P40425 430 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF787Q6DD87 383 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 LAPTM4AQ15012 233 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 BOLA1Q9Y3E2 137 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUBP1P53384 320 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARSIQ5FYB1 569 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.22□□□□□ -1.73
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYE4A6NLX3 237 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 GFRA3O60609 400 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-871P-201ENST00000516122 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
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