RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.29□□□□□ -0.76
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEDQ86YR6 584 aa10.22□□□□□ -0.77
RNU6-871P-201ENST00000516122 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXD1Q16676 465 aa9.14□□□□□ -0.95
RNU6-871P-201ENST00000516122 MSH5O43196 834 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEHQ6S545 545 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADRA2BP18089 450 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-871P-201ENST00000516122 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF39Q9H2S5 420 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-871P-201ENST00000516122 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSG3P32926 999 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPN15O75808 1086 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-871P-201ENST00000516122 LHX8Q68G74 356 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 EVX2Q03828 476 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAX1O00165 279 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCB7O75027 752 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-871P-201ENST00000516122 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEMA6NI47 508 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 GABBR2O75899 941 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEIP0CG38 1075 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEGQ6S5H5 508 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKT1S1Q96B36 256 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 PITPNM1O00562 1244 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 OTUD5Q96G74 571 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-871P-201ENST00000516122 APLP2Q06481 763 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEB2H3BUK9 544 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC4A2P04920 1241 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLA2Q14181 598 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RNU6-871P-201ENST00000516122 OSCARQ8IYS5 282 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEJP0CG39 1038 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMRN1Q13201 1228 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCBLD2Q96PD2 775 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCN6P51797 869 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHADLQ6NUI6 762 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-871P-201ENST00000516122 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 METRNQ9UJH8 293 aa5.33□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYE6P0CI01 402 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPDYE2Q495Y8 402 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-871P-201ENST00000516122 ST18O60284 1047 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 POTEFA5A3E0 1075 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZRANB1Q9UGI0 708 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 C7P10643 843 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC39A7Q92504 469 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR29P0C7W0 189 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF12Q96QT6 1004 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
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