RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-211ENST00000489450 NUBP1P53384 320 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-211ENST00000489450 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-211ENST00000489450 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-211ENST00000489450 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-211ENST00000489450 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-211ENST00000489450 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF12Q96QT6 1004 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 RASEFQ8IZ41 740 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 GSE1Q14687 1217 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM212AQ96EL1 285 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-211ENST00000489450 RGL2O15211 777 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM41Q8WV44 630 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEB2H3BUK9 544 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 PYGBP11216 843 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 OTUD5Q96G74 571 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-211ENST00000489450 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC24A1O60721 1099 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF12Q96FN5 646 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 METRNQ9UJH8 293 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGGTB-211ENST00000489450 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC39A7Q92504 469 aa8.33□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 C7P10643 843 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCB2Q00722 1185 aa8.32□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPC6Q9Y210 931 aa8.31□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K13O43283 966 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEJP0CG39 1038 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 STK25O00506 426 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RABGGTB-211ENST00000489450 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 TIE1P35590 1138 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNL1Q8IU54 200 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 CFAP44Q96MT7 982 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEFA5A3E0 1075 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 STK24Q9Y6E0 443 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-211ENST00000489450 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PSEN1P49768 467 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEMA6NI47 508 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 POTEGQ6S5H5 508 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-211ENST00000489450 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC24BO95487 1268 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 IER5LQ5T953 404 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 CABP2Q9NPB3 220 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-211ENST00000489450 MFRPQ9BY79 579 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA2Q08379 1002 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX12O15370 315 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-211ENST00000489450 PLCG2P16885 1265 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 NLRP6P59044 892 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP1R37O75864 691 aa8□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.99□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.98□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 OCEL1Q9H607 264 aa7.97□□□□□ -1.13
RABGGTB-211ENST00000489450 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.95□□□□□ -1.14
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