RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 USP35Q9P2H5 1018 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 ITGAEP38570 1179 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 IL27Q8NEV9 243 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-209ENST00000442510 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 AAMPQ13685 434 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO3Q9UK99 471 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 WWC1Q8IX03 1113 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 MIER1Q8N108 512 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-209ENST00000442510 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 ARID3AQ99856 593 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD1Q99460 953 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 MAP7D2Q96T17 732 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 CFAP44Q96MT7 982 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 TAF3Q5VWG9 929 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-209ENST00000442510 FAM193AP78312 1265 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 GSE1Q14687 1217 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 CLGNO14967 610 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 ANP32CO43423 234 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 CLSTN1O94985 981 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 CNPY4Q8N129 248 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 TPM2P07951 284 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-209ENST00000442510 RGS3P49796 1198 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 E9PSI1 815 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC66A2RUB6 948 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM52Q96A61 297 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 BECN1Q14457 450 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF592Q92610 1267 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.268e-6■■■□□ 16.1
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 VGLL3A8MV65 326 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM41Q8WV44 630 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-209ENST00000442510 TICAM2Q86XR7 235 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms