RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NEK1-201ENST00000439128 CLIP1P30622 1438 aa16.39■□□□□ 0.21
NEK1-201ENST00000439128 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
NEK1-201ENST00000439128 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
NEK1-201ENST00000439128 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.36■□□□□ 0.21
NEK1-201ENST00000439128 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.36■□□□□ 0.21
NEK1-201ENST00000439128 POGKQ9P215 609 aa16.35■□□□□ 0.21
NEK1-201ENST00000439128 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 NPHP1O15259 732 aa16.3■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.3■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 GGT6Q6P531 493 aa16.27■□□□□ 0.2
NEK1-201ENST00000439128 CUX2O14529 1486 aa16.25■□□□□ 0.19
NEK1-201ENST00000439128 GOLGA3Q08378 1498 aa16.25■□□□□ 0.19
NEK1-201ENST00000439128 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.24■□□□□ 0.19
NEK1-201ENST00000439128 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
NEK1-201ENST00000439128 KANK1Q14678 1352 aa16.23■□□□□ 0.19
NEK1-201ENST00000439128 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.21■□□□□ 0.19
NEK1-201ENST00000439128 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.2■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.2■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 EEA1Q15075 1411 aa16.18■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.16■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 SOGA1O94964 1423 aa16.16■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 SOX12O15370 315 aa16.15■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 CFAP53Q96M91 514 aa16.15■□□□□ 0.18
NEK1-201ENST00000439128 CDCA8Q53HL2 280 aa16.14■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 SMARCA2P51531 1590 aa16.13■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.12■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 MYH16Q9H6N6 1097 aa16.12■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 OSCARQ8IYS5 282 aa16.12■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.11■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.1■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 MRS2Q9HD23 443 aa16.1■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 CEP162Q5TB80 1403 aa16.08■□□□□ 0.17
NEK1-201ENST00000439128 STK26Q9P289 416 aa16.08■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.07■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 EID1Q9Y6B2 187 aa16.02■□□□□ 0.16
NEK1-201ENST00000439128 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.02■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 NUDCQ9Y266 331 aa16.01■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 NEUROD2Q15784 382 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.99■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.98■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 KIF3BO15066 747 aa15.97■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 JPH4Q96JJ6 628 aa15.96■□□□□ 0.15
NEK1-201ENST00000439128 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.95■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.93■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.92■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 GOLGA2Q08379 1002 aa15.91■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NEK1-201ENST00000439128 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.138e-6■■■■□ 19.5
NEK1-201ENST00000439128 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.89■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 FKBP8Q14318 412 aa15.88■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 TMF1P82094 1093 aa15.87■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.86■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 PKD2Q13563 968 aa15.84■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.83■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
NEK1-201ENST00000439128 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 NUTM2FA1L443 756 aa15.82■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.82■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 MORC1Q86VD1 984 aa15.81■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 ABCC8Q09428 1581 aa15.81■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 PTPRGP23470 1445 aa15.8■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.79■□□□□ 0.12
NEK1-201ENST00000439128 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.79■□□□□ 0.12
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