RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CCDC82-202ENST00000423339 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCDC82-202ENST00000423339 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC82-202ENST00000423339 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CCDC82-202ENST00000423339 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC82-202ENST00000423339 CSRNP3Q8WYN3 585 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC82-202ENST00000423339 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CCDC82-202ENST00000423339 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.23□□□□□ -0.77
CCDC82-202ENST00000423339 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CCDC82-202ENST00000423339 POTEJP0CG39 1038 aa10.21□□□□□ -0.77
CCDC82-202ENST00000423339 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CCDC82-202ENST00000423339 PLEKHG5O94827 1062 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.18□□□□□ -0.78
CCDC82-202ENST00000423339 KIF12Q96FN5 646 aa10.16□□□□□ -0.78
CCDC82-202ENST00000423339 TIE1P35590 1138 aa10.15□□□□□ -0.78
CCDC82-202ENST00000423339 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCDC82-202ENST00000423339 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCDC82-202ENST00000423339 SEC24BO95487 1268 aa10.11□□□□□ -0.79
CCDC82-202ENST00000423339 PROM2Q8N271 834 aa10.08□□□□□ -0.8
CCDC82-202ENST00000423339 POTEFA5A3E0 1075 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC82-202ENST00000423339 MAP3K13O43283 966 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC82-202ENST00000423339 IER5LQ5T953 404 aa10.06□□□□□ -0.8
CCDC82-202ENST00000423339 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.04□□□□□ -0.8
CCDC82-202ENST00000423339 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.03□□□□□ -0.8
CCDC82-202ENST00000423339 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.02□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 MIER1Q8N108 512 aa10.02□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 TRPC6Q9Y210 931 aa10.01□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 RASEFQ8IZ41 740 aa9.98□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.96□□□□□ -0.81
CCDC82-202ENST00000423339 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.95□□□□□ -0.82
CCDC82-202ENST00000423339 PLCG2P16885 1265 aa9.92□□□□□ -0.82
CCDC82-202ENST00000423339 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.91□□□□□ -0.82
CCDC82-202ENST00000423339 ST18O60284 1047 aa9.9□□□□□ -0.82
CCDC82-202ENST00000423339 SNPHO15079 494 aa9.89□□□□□ -0.83
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.86□□□□□ -0.83
CCDC82-202ENST00000423339 FAM212AQ96EL1 285 aa9.85□□□□□ -0.83
CCDC82-202ENST00000423339 IFNL1Q8IU54 200 aa9.83□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 NUBP1P53384 320 aa9.81□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 MMRN1Q13201 1228 aa9.8□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 OCEL1Q9H607 264 aa9.79□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.78□□□□□ -0.84
CCDC82-202ENST00000423339 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.67□□□□□ -0.86
CCDC82-202ENST00000423339 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.67□□□□□ -0.86
CCDC82-202ENST00000423339 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CCDC82-202ENST00000423339 MARVELD3Q96A59 401 aa9.66□□□□□ -0.86
CCDC82-202ENST00000423339 EMP3P54852 163 aa9.65□□□□□ -0.86
CCDC82-202ENST00000423339 GOLGA2Q08379 1002 aa9.64□□□□□ -0.87
CCDC82-202ENST00000423339 PYGBP11216 843 aa9.62□□□□□ -0.87
CCDC82-202ENST00000423339 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.59□□□□□ -0.87
CCDC82-202ENST00000423339 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CCDC82-202ENST00000423339 GSE1Q14687 1217 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC82-202ENST00000423339 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.55□□□□□ -0.88
CCDC82-202ENST00000423339 FAM205CA6NFA0 338 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC82-202ENST00000423339 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.881e-7■■■■□ 25.8
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO3Q9UK99 471 aa9.53□□□□□ -0.88
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC82-202ENST00000423339 G3V3G9 751 aa9.51□□□□□ -0.89
CCDC82-202ENST00000423339 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CCDC82-202ENST00000423339 PSEN1P49768 467 aa9.46□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 POTEB3A0JP26 581 aa9.45□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 FKBP8Q14318 412 aa9.45□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 POTEBQ6S5H4 581 aa9.45□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 KLHL34Q8N239 644 aa9.44□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.43□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 DOK7Q18PE1 504 aa9.42□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
CCDC82-202ENST00000423339 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.91
CCDC82-202ENST00000423339 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.4□□□□□ -0.91
CCDC82-202ENST00000423339 RIMBP2O15034 1052 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC82-202ENST00000423339 ERBB3P21860 1342 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC82-202ENST00000423339 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC82-202ENST00000423339 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
CCDC82-202ENST00000423339 PTGER2P43116 358 aa9.33□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.32□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 CABP2Q9NPB3 220 aa9.32□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.32□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.25□□□□□ -0.93
CCDC82-202ENST00000423339 SPOCK2Q92563 424 aa9.22□□□□□ -0.93
CCDC82-202ENST00000423339 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM41Q8WV44 630 aa9.19□□□□□ -0.94
CCDC82-202ENST00000423339 MICALL2Q8IY33 904 aa9.15□□□□□ -0.94
CCDC82-202ENST00000423339 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.15□□□□□ -0.95
CCDC82-202ENST00000423339 GPR153Q6NV75 609 aa9.14□□□□□ -0.95
CCDC82-202ENST00000423339 SOX12O15370 315 aa9.13□□□□□ -0.95
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.12□□□□□ -0.95
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CCDC82-202ENST00000423339 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.965e-8■■■■■ 34.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms