RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
RNU2-38P-201ENST00000410856 PROM2Q8N271 834 aa9.3□□□□□ -0.92
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLEKHG5O94827 1062 aa9.28□□□□□ -0.92
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.27□□□□□ -0.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 POTEMA6NI47 508 aa9.26□□□□□ -0.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.25□□□□□ -0.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 POTEGQ6S5H5 508 aa9.22□□□□□ -0.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.21□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIF12Q96FN5 646 aa9.2□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.18□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TIE1P35590 1138 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 MIER1Q8N108 512 aa9.17□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 POTEJP0CG39 1038 aa9.15□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP3K13O43283 966 aa9.13□□□□□ -0.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 RASEFQ8IZ41 740 aa9.12□□□□□ -0.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.1□□□□□ -0.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.09□□□□□ -0.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRPC6Q9Y210 931 aa9.09□□□□□ -0.95
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEC24BO95487 1268 aa9.08□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 POTEFA5A3E0 1075 aa9.07□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.07□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 IER5LQ5T953 404 aa9.06□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM212AQ96EL1 285 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU2-38P-201ENST00000410856 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUBP1P53384 320 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU2-38P-201ENST00000410856 IFNL1Q8IU54 200 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLCG2P16885 1265 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 FKBP8Q14318 412 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 ST18O60284 1047 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 OCEL1Q9H607 264 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 FBXO3Q9UK99 471 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU2-38P-201ENST00000410856 PYGBP11216 843 aa8.82□□□□□ -1
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNPHO15079 494 aa8.81□□□□□ -1
RNU2-38P-201ENST00000410856 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSE1Q14687 1217 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 GOLGA2Q08379 1002 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLHL34Q8N239 644 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU2-38P-201ENST00000410856 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 MMRN1Q13201 1228 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 MARVELD3Q96A59 401 aa8.66□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
RNU2-38P-201ENST00000410856 EMP3P54852 163 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU2-38P-201ENST00000410856 PSEN1P49768 467 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RNU2-38P-201ENST00000410856 G3V3G9 751 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU2-38P-201ENST00000410856 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU2-38P-201ENST00000410856 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM205CA6NFA0 338 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPOCK2Q92563 424 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU2-38P-201ENST00000410856 CABP2Q9NPB3 220 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU2-38P-201ENST00000410856 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 DOK7Q18PE1 504 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 POTEB3A0JP26 581 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 POTEBQ6S5H4 581 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM41Q8WV44 630 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIMBP2O15034 1052 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU2-38P-201ENST00000410856 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU2-38P-201ENST00000410856 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERBB3P21860 1342 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU2-38P-201ENST00000410856 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU2-38P-201ENST00000410856 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU2-38P-201ENST00000410856 MICALL2Q8IY33 904 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOX12O15370 315 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTGER2P43116 358 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU2-38P-201ENST00000410856 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.29□□□□□ -1.08
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