RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-205ENST00000391970 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-205ENST00000391970 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-205ENST00000391970 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-205ENST00000391970 CHADLQ6NUI6 762 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-205ENST00000391970 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 CFAP44Q96MT7 982 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 PYGBP11216 843 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-205ENST00000391970 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 STK25O00506 426 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-205ENST00000391970 HAX1O00165 279 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 STK24Q9Y6E0 443 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 EVX2Q03828 476 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-205ENST00000391970 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 BCANQ96GW7 911 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 KIF12Q96FN5 646 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K13O43283 966 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 PSEN1P49768 467 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 IFNL1Q8IU54 200 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-205ENST00000391970 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-205ENST00000391970 PHF12Q96QT6 1004 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-205ENST00000391970 MFRPQ9BY79 579 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-205ENST00000391970 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 CABP2Q9NPB3 220 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 SOX12O15370 315 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 GABBR2O75899 941 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 NLRP6P59044 892 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-205ENST00000391970 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 TRPC6Q9Y210 931 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R37O75864 691 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 NBR1Q14596 966 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 TIE1P35590 1138 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 GOLGA2Q08379 1002 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-205ENST00000391970 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 P3H3Q8IVL6 736 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 WDR70Q9NW82 654 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 CLCN6P51797 869 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 POTEIP0CG38 1075 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-205ENST00000391970 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 MFSD10Q14728 455 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 PDE4AP27815 886 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 E2F4Q16254 413 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-205ENST00000391970 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 IER5LQ5T953 404 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 MICALL2Q8IY33 904 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRC-205ENST00000391970 CAMK2BQ13554 666 aa6.98□□□□□ -1.29
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