RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391208.1

RNU6-972P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 972, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-972P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-972P-201ENST00000391208 SNPHO15079 494 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-972P-201ENST00000391208 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-972P-201ENST00000391208 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-972P-201ENST00000391208 SEC24BO95487 1268 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-972P-201ENST00000391208 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-972P-201ENST00000391208 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-972P-201ENST00000391208 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-972P-201ENST00000391208 MARVELD3Q96A59 401 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-972P-201ENST00000391208 POTEFA5A3E0 1075 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-972P-201ENST00000391208 EMP3P54852 163 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-972P-201ENST00000391208 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-972P-201ENST00000391208 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 IER5LQ5T953 404 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 CREBZFQ9NS37 354 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 FAM205CA6NFA0 338 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 TIE1P35590 1138 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-972P-201ENST00000391208 PTGER2P43116 358 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-972P-201ENST00000391208 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-972P-201ENST00000391208 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 POTEB3A0JP26 581 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 PLCG2P16885 1265 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 POTEBQ6S5H4 581 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
RNU6-972P-201ENST00000391208 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-972P-201ENST00000391208 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-972P-201ENST00000391208 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-972P-201ENST00000391208 RGS20O76081 388 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-972P-201ENST00000391208 KIF12Q96FN5 646 aa6.17□□□□□ -1.42
RNU6-972P-201ENST00000391208 KCNA4P22459 653 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-972P-201ENST00000391208 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-972P-201ENST00000391208 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRPC6Q9Y210 931 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-972P-201ENST00000391208 ERBB3P21860 1342 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-972P-201ENST00000391208 HCSTQ9UBK5 93 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-972P-201ENST00000391208 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-972P-201ENST00000391208 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-972P-201ENST00000391208 OCEL1Q9H607 264 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-972P-201ENST00000391208 MAP3K13O43283 966 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-972P-201ENST00000391208 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-972P-201ENST00000391208 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 Q6ZNB5 142 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF710Q8N1W2 664 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-972P-201ENST00000391208 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 RIMBP2O15034 1052 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 DOK7Q18PE1 504 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-972P-201ENST00000391208 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-972P-201ENST00000391208 LAPTM4AQ15012 233 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-972P-201ENST00000391208 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-972P-201ENST00000391208 IFFO2Q5TF58 517 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.79□□□□□ -1.48
RNU6-972P-201ENST00000391208 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.78□□□□□ -1.48
RNU6-972P-201ENST00000391208 IFNL1Q8IU54 200 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 A0A0G2JS52 829 aa5.76□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 G3V3G9 751 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 PLEKHG5O94827 1062 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 PBX2P40425 430 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF787Q6DD87 383 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-972P-201ENST00000391208 GOLGA2Q08379 1002 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-972P-201ENST00000391208 RASEFQ8IZ41 740 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-972P-201ENST00000391208 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZBTB22O15209 634 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-972P-201ENST00000391208 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-972P-201ENST00000391208 STK17AQ9UEE5 414 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 STAC3Q96MF2 364 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 GPR153Q6NV75 609 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 LCE2BO14633 110 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-972P-201ENST00000391208 GFRA3O60609 400 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-972P-201ENST00000391208 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-972P-201ENST00000391208 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-972P-201ENST00000391208 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RNU6-972P-201ENST00000391208 TK2O00142 265 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-972P-201ENST00000391208 FAM212AQ96EL1 285 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-972P-201ENST00000391208 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-972P-201ENST00000391208 PTPN5P54829 565 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-972P-201ENST00000391208 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-972P-201ENST00000391208 ARSIQ5FYB1 569 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-972P-201ENST00000391208 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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