RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MARVELD3Q96A59 401 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SEC24BO95487 1268 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-1275P-201ENST00000391087 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EMP3P54852 163 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SNPHO15079 494 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POTEB3A0JP26 581 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POTEBQ6S5H4 581 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CREBZFQ9NS37 354 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM205CA6NFA0 338 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRPC6Q9Y210 931 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TIE1P35590 1138 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNA4P22459 653 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IER5LQ5T953 404 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLCG2P16885 1265 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KIF12Q96FN5 646 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAP3K13O43283 966 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PTGER2P43116 358 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ERBB3P21860 1342 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 Q6ZNB5 142 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OCEL1Q9H607 264 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HCSTQ9UBK5 93 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RGS20O76081 388 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IFNL1Q8IU54 200 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DOK7Q18PE1 504 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RASEFQ8IZ41 740 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LCE2BO14633 110 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RIMBP2O15034 1052 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A0G2JS52 829 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF787Q6DD87 383 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZBTB22O15209 634 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IFFO2Q5TF58 517 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LAPTM4AQ15012 233 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 G3V3G9 751 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GPR153Q6NV75 609 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GOLGA2Q08379 1002 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PBX2P40425 430 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GFRA3O60609 400 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PTPN5P54829 565 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARSIQ5FYB1 569 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLEKHG5O94827 1062 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STK17AQ9UEE5 414 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STAC3Q96MF2 364 aa6.23□□□□□ -1.41
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