RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 METRNQ9UJH8 293 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 POTEMA6NI47 508 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 PROM2Q8N271 834 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 POTEGQ6S5H5 508 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHG5O94827 1062 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIF12Q96FN5 646 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 POTEJP0CG39 1038 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 TIE1P35590 1138 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-407P-201ENST00000365280 MIER1Q8N108 512 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP3K13O43283 966 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 RASEFQ8IZ41 740 aa6.81□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 POTEFA5A3E0 1075 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRPC6Q9Y210 931 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 SEC24BO95487 1268 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 IER5LQ5T953 404 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUBP1P53384 320 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM212AQ96EL1 285 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFNL1Q8IU54 200 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLCG2P16885 1265 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-407P-201ENST00000365280 ST18O60284 1047 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 OCEL1Q9H607 264 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNPHO15079 494 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 FKBP8Q14318 412 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 PYGBP11216 843 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 FBXO3Q9UK99 471 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-407P-201ENST00000365280 GOLGA2Q08379 1002 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 GSE1Q14687 1217 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 MMRN1Q13201 1228 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 MARVELD3Q96A59 401 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 EMP3P54852 163 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 KLHL34Q8N239 644 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-407P-201ENST00000365280 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSEN1P49768 467 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 G3V3G9 751 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM205CA6NFA0 338 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 CABP2Q9NPB3 220 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 POTEB3A0JP26 581 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 POTEBQ6S5H4 581 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPOCK2Q92563 424 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 DOK7Q18PE1 504 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIMBP2O15034 1052 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM41Q8WV44 630 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 ERBB3P21860 1342 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MICALL2Q8IY33 904 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTGER2P43116 358 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 SOX12O15370 315 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR153Q6NV75 609 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.19□□□□□ -1.42
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