RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRO-202ENST00000348962 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRO-202ENST00000348962 KIF27Q86VH2 1401 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 PLEKHG5O94827 1062 aa20.66■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 RGL3Q3MIN7 710 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRO-202ENST00000348962 MRS2Q9HD23 443 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA3Q08378 1498 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRO-202ENST00000348962 CDCA8Q53HL2 280 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRO-202ENST00000348962 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRO-202ENST00000348962 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRO-202ENST00000348962 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.56■□□□□ 0.88
PTPRO-202ENST00000348962 FKBP8Q14318 412 aa20.55■□□□□ 0.88
PTPRO-202ENST00000348962 CFAP53Q96M91 514 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRO-202ENST00000348962 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRO-202ENST00000348962 POGKQ9P215 609 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRO-202ENST00000348962 CEP162Q5TB80 1403 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRO-202ENST00000348962 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRO-202ENST00000348962 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 ARXQ96QS3 562 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRO-202ENST00000348962 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRO-202ENST00000348962 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRO-202ENST00000348962 MLECQ14165 292 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRO-202ENST00000348962 NUDCQ9Y266 331 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRO-202ENST00000348962 KANK1Q14678 1352 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRO-202ENST00000348962 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRO-202ENST00000348962 CUX2O14529 1486 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRO-202ENST00000348962 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRO-202ENST00000348962 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRO-202ENST00000348962 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.27■□□□□ 0.83
PTPRO-202ENST00000348962 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PTPRO-202ENST00000348962 NPHP1O15259 732 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRO-202ENST00000348962 GGT6Q6P531 493 aa20.23■□□□□ 0.83
PTPRO-202ENST00000348962 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRO-202ENST00000348962 NEUROD2Q15784 382 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 TMF1P82094 1093 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 MIER1Q8N108 512 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PTPRO-202ENST00000348962 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 SOGA1O94964 1423 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 CASC1Q6TDU7 716 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 SMARCA2P51531 1590 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 BECN1Q14457 450 aa20.08■□□□□ 0.81
PTPRO-202ENST00000348962 MS4A1P11836 297 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRO-202ENST00000348962 SOX12O15370 315 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRO-202ENST00000348962 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRO-202ENST00000348962 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
PTPRO-202ENST00000348962 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRO-202ENST00000348962 STK26Q9P289 416 aa20.02■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 PKD2Q13563 968 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 MORC1Q86VD1 984 aa20.01■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 GOLGA2Q08379 1002 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 FMN1Q68DA7 1419 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRO-202ENST00000348962 KIF3BO15066 747 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 EID1Q9Y6B2 187 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.94■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.93■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 NUP155O75694 1391 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 JPH4Q96JJ6 628 aa19.91■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.9■□□□□ 0.78
PTPRO-202ENST00000348962 FGD1P98174 961 aa19.9■□□□□ 0.78
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