RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.86■■■□□ 2.37
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PTPRM-201ENST00000332175 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPRM-201ENST00000332175 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.75■■■□□ 2.35
PTPRM-201ENST00000332175 RGL3Q3MIN7 710 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRM-201ENST00000332175 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
PTPRM-201ENST00000332175 MIER1Q8N108 512 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRM-201ENST00000332175 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
PTPRM-201ENST00000332175 CLIP1P30622 1438 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRM-201ENST00000332175 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.55■■■□□ 2.32
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRM-201ENST00000332175 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PTPRM-201ENST00000332175 TPRNQ4KMQ1 711 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRM-201ENST00000332175 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP53Q96M91 514 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRM-201ENST00000332175 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PTPRM-201ENST00000332175 NEUROD2Q15784 382 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRM-201ENST00000332175 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 NCLP19338 710 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 BECN1Q14457 450 aa29.34■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRM-201ENST00000332175 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PTPRM-201ENST00000332175 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA3Q08378 1498 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRM-201ENST00000332175 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRM-201ENST00000332175 CEP162Q5TB80 1403 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPRM-201ENST00000332175 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPRM-201ENST00000332175 POGKQ9P215 609 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPRM-201ENST00000332175 CDCA8Q53HL2 280 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRM-201ENST00000332175 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.23■■■□□ 2.27
PTPRM-201ENST00000332175 CASC1Q6TDU7 716 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L22H0YM25 854 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 NPHP1O15259 732 aa29.18■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.14■■■□□ 2.26
PTPRM-201ENST00000332175 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.13■■■□□ 2.25
PTPRM-201ENST00000332175 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PTPRM-201ENST00000332175 NUDCQ9Y266 331 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPRM-201ENST00000332175 ERCC6Q03468 1493 aa29.1■■■□□ 2.25
PTPRM-201ENST00000332175 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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PTPRM-201ENST00000332175 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
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PTPRM-201ENST00000332175 SOX12O15370 315 aa29.06■■■□□ 2.24
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.97■■■□□ 2.23
PTPRM-201ENST00000332175 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PTPRM-201ENST00000332175 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
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PTPRM-201ENST00000332175 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.95■■■□□ 2.22
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PTPRM-201ENST00000332175 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRM-201ENST00000332175 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRM-201ENST00000332175 FGD1P98174 961 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRM-201ENST00000332175 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRM-201ENST00000332175 KCNJ4P48050 445 aa28.88■■■□□ 2.21
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PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA2Q08379 1002 aa28.88■■■□□ 2.21
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
PTPRM-201ENST00000332175 TMF1P82094 1093 aa28.84■■■□□ 2.21
PTPRM-201ENST00000332175 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRM-201ENST00000332175 KANK1Q14678 1352 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRM-201ENST00000332175 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.8■■■□□ 2.2
PTPRM-201ENST00000332175 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PTPRM-201ENST00000332175 STK26Q9P289 416 aa28.79■■■□□ 2.2
PTPRM-201ENST00000332175 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRM-201ENST00000332175 MORC1Q86VD1 984 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
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PTPRM-201ENST00000332175 MS4A1P11836 297 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRM-201ENST00000332175 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.71■■■□□ 2.19
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PTPRM-201ENST00000332175 FOXD1Q16676 465 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRM-201ENST00000332175 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRM-201ENST00000332175 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PTPRM-201ENST00000332175 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PTPRM-201ENST00000332175 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 CLSTN1O94985 981 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 CUX2O14529 1486 aa28.62■■■□□ 2.17
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