RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282096.8

PDE3B-201, Transcript of phosphodiesterase 3B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE3B, Length 6,076 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3B-201ENST00000282096 MRS2Q9HD23 443 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 BECN1Q14457 450 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 KCNH8Q96L42 1107 aa23.39■■□□□ 1.34
PDE3B-201ENST00000282096 TSPY4P0CV99 314 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 TSPY10P0CW01 314 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PDE3B-201ENST00000282096 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.32■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L22H0YM25 854 aa23.31■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.29■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.28■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PDE3B-201ENST00000282096 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 C14orf37Q86TY3 774 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.21■■□□□ 1.31
PDE3B-201ENST00000282096 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
PDE3B-201ENST00000282096 A0A0G2JS52 829 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE3B-201ENST00000282096 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE3B-201ENST00000282096 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.12■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PDE3B-201ENST00000282096 PLCB2Q00722 1185 aa23.08■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 CLIP1P30622 1438 aa23.05■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 PLEKHG5O94827 1062 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA3Q08378 1498 aa22.99■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 EEA1Q15075 1411 aa22.99■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 CEP162Q5TB80 1403 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 CASC1Q6TDU7 716 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE3B-201ENST00000282096 RGS3P49796 1198 aa22.94■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.93■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 KIF27Q86VH2 1401 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE3B-201ENST00000282096 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.84■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE3B-201ENST00000282096 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 ARID3AQ99856 593 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.77■■□□□ 1.24
PDE3B-201ENST00000282096 MLECQ14165 292 aa22.76■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 NEUROD2Q15784 382 aa22.74■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 NRDCO43847 1150 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 RGL3Q3MIN7 710 aa22.7■■□□□ 1.23
PDE3B-201ENST00000282096 HSCBQ8IWL3 235 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 DRC7Q8IY82 874 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 CFAP53Q96M91 514 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.64■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 FGD1P98174 961 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 POGKQ9P215 609 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 CCER2I3L3R5 266 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 CUX2O14529 1486 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 KANK1Q14678 1352 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PDE3B-201ENST00000282096 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.58■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 KCNJ4P48050 445 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 SMARCA2P51531 1590 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 CDCA8Q53HL2 280 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PDE3B-201ENST00000282096 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.54■■□□□ 1.2
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