RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSPAN3-201ENST00000267970 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TSPAN3-201ENST00000267970 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSPAN3-201ENST00000267970 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 C14orf37Q86TY3 774 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 PLCB2Q00722 1185 aa22.22■■□□□ 1.15
TSPAN3-201ENST00000267970 BECN1Q14457 450 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN3-201ENST00000267970 NEUROD2Q15784 382 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN3-201ENST00000267970 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN3-201ENST00000267970 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 RGS3P49796 1198 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 RGL3Q3MIN7 710 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 ARID3AQ99856 593 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-201ENST00000267970 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.02■■□□□ 1.12
TSPAN3-201ENST00000267970 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TSPAN3-201ENST00000267970 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TSPAN3-201ENST00000267970 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.92■■□□□ 1.1
TSPAN3-201ENST00000267970 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
TSPAN3-201ENST00000267970 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 TSPY4P0CV99 314 aa21.89■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 TSPY10P0CW01 314 aa21.89■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 KCNH8Q96L42 1107 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 CASC1Q6TDU7 716 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.84■■□□□ 1.09
TSPAN3-201ENST00000267970 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-201ENST00000267970 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN3-201ENST00000267970 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN3-201ENST00000267970 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TSPAN3-201ENST00000267970 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.76■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 FGD1P98174 961 aa21.75■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 SOX12O15370 315 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 APBB1O00213 710 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 KCNJ4P48050 445 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 CFAP53Q96M91 514 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN3-201ENST00000267970 SCRIBQ14160 1630 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 DRC7Q8IY82 874 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 CLSTN1O94985 981 aa21.68■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.68■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 NPHP1O15259 732 aa21.65■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 HSCBQ8IWL3 235 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CLIP1P30622 1438 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 PDE4CQ08493 712 aa21.55■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.54■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 POGKQ9P215 609 aa21.52■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA2Q08379 1002 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-201ENST00000267970 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-201ENST00000267970 NUDCQ9Y266 331 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-201ENST00000267970 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CEP162Q5TB80 1403 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NRDCO43847 1150 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXD1Q16676 465 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CDCA8Q53HL2 280 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.2 ms