RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267970.8

TSPAN3-201, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN3, Length 6,467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-201ENST00000267970 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
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TSPAN3-201ENST00000267970 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSPAN3-201ENST00000267970 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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TSPAN3-201ENST00000267970 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.25■■□□□ 1.15
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TSPAN3-201ENST00000267970 C14orf37Q86TY3 774 aa22.24■■□□□ 1.15
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TSPAN3-201ENST00000267970 NEUROD2Q15784 382 aa22.16■■□□□ 1.14
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TSPAN3-201ENST00000267970 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 RGS3P49796 1198 aa22.13■■□□□ 1.13
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TSPAN3-201ENST00000267970 RGL3Q3MIN7 710 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 ARID3AQ99856 593 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN3-201ENST00000267970 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.02■■□□□ 1.12
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TSPAN3-201ENST00000267970 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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TSPAN3-201ENST00000267970 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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TSPAN3-201ENST00000267970 TSPY10P0CW01 314 aa21.89■■□□□ 1.09
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TSPAN3-201ENST00000267970 KCNH8Q96L42 1107 aa21.88■■□□□ 1.09
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TSPAN3-201ENST00000267970 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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TSPAN3-201ENST00000267970 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.82■■□□□ 1.08
TSPAN3-201ENST00000267970 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.78■■□□□ 1.08
TSPAN3-201ENST00000267970 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.78■■□□□ 1.08
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TSPAN3-201ENST00000267970 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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TSPAN3-201ENST00000267970 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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TSPAN3-201ENST00000267970 SOX12O15370 315 aa21.74■■□□□ 1.07
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TSPAN3-201ENST00000267970 DRC7Q8IY82 874 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 CLSTN1O94985 981 aa21.68■■□□□ 1.06
TSPAN3-201ENST00000267970 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.68■■□□□ 1.06
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TSPAN3-201ENST00000267970 CLIP1P30622 1438 aa21.61■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.6■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.59■■□□□ 1.05
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TSPAN3-201ENST00000267970 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
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TSPAN3-201ENST00000267970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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TSPAN3-201ENST00000267970 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 POGKQ9P215 609 aa21.52■■□□□ 1.04
TSPAN3-201ENST00000267970 GOLGA2Q08379 1002 aa21.49■■□□□ 1.03
TSPAN3-201ENST00000267970 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-201ENST00000267970 NUDCQ9Y266 331 aa21.47■■□□□ 1.03
TSPAN3-201ENST00000267970 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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TSPAN3-201ENST00000267970 CEP162Q5TB80 1403 aa21.43■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 NRDCO43847 1150 aa21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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TSPAN3-201ENST00000267970 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TSPAN3-201ENST00000267970 CDCA8Q53HL2 280 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.39■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.34■■□□□ 1.01
TSPAN3-201ENST00000267970 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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