RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NOMO3-201ENST00000263012 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.17■■□□□ 1.46
NOMO3-201ENST00000263012 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.16■■□□□ 1.46
NOMO3-201ENST00000263012 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
NOMO3-201ENST00000263012 EEA1Q15075 1411 aa24.14■■□□□ 1.46
NOMO3-201ENST00000263012 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-201ENST00000263012 FOXD1Q16676 465 aa24.1■■□□□ 1.45
NOMO3-201ENST00000263012 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.09■■□□□ 1.45
NOMO3-201ENST00000263012 ARXQ96QS3 562 aa24.09■■□□□ 1.45
NOMO3-201ENST00000263012 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NOMO3-201ENST00000263012 TMC1Q8TDI8 760 aa24.08■■□□□ 1.45
NOMO3-201ENST00000263012 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-201ENST00000263012 NACADO15069 1562 aa24.07■■□□□ 1.44
NOMO3-201ENST00000263012 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-201ENST00000263012 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.05■■□□□ 1.44
NOMO3-201ENST00000263012 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
NOMO3-201ENST00000263012 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.02■■□□□ 1.44
NOMO3-201ENST00000263012 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
NOMO3-201ENST00000263012 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.99■■□□□ 1.43
NOMO3-201ENST00000263012 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
NOMO3-201ENST00000263012 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.86■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 RGL3Q3MIN7 710 aa23.84■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NOMO3-201ENST00000263012 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
NOMO3-201ENST00000263012 KIF27Q86VH2 1401 aa23.8■■□□□ 1.4
NOMO3-201ENST00000263012 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.78■■□□□ 1.4
NOMO3-201ENST00000263012 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
NOMO3-201ENST00000263012 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
NOMO3-201ENST00000263012 CCER2I3L3R5 266 aa23.72■■□□□ 1.39
NOMO3-201ENST00000263012 NEFMP07197 916 aa23.67■■□□□ 1.38
NOMO3-201ENST00000263012 SMARCA2P51531 1590 aa23.65■■□□□ 1.38
NOMO3-201ENST00000263012 CUX2O14529 1486 aa23.65■■□□□ 1.38
NOMO3-201ENST00000263012 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.64■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 RGS3P49796 1198 aa23.62■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 SMARCA4P51532 1647 aa23.6■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.59■■□□□ 1.37
NOMO3-201ENST00000263012 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NOMO3-201ENST00000263012 NEUROD2Q15784 382 aa23.52■■□□□ 1.36
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC184Q52MB2 194 aa23.52■■□□□ 1.36
NOMO3-201ENST00000263012 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.5■■□□□ 1.35
NOMO3-201ENST00000263012 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
NOMO3-201ENST00000263012 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.46■■□□□ 1.35
NOMO3-201ENST00000263012 TSPY4P0CV99 314 aa23.46■■□□□ 1.35
NOMO3-201ENST00000263012 TSPY10P0CW01 314 aa23.46■■□□□ 1.35
NOMO3-201ENST00000263012 SLC4A3P48751 1232 aa23.46■■□□□ 1.35
NOMO3-201ENST00000263012 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.45■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 MSH5O43196 834 aa23.43■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 PLIN1O60240 522 aa23.41■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.41■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 SYNJ1O43426 1573 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 KIF21BO75037 1637 aa23.4■■□□□ 1.34
NOMO3-201ENST00000263012 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.39■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.37■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.36■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 PKD2Q13563 968 aa23.34■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 ARAP1Q96P48 1450 aa23.34■■□□□ 1.33
NOMO3-201ENST00000263012 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.32■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 SLC24A1O60721 1099 aa23.3■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.3■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.3■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.27■■□□□ 1.32
NOMO3-201ENST00000263012 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NOMO3-201ENST00000263012 NUDCQ9Y266 331 aa23.26■■□□□ 1.31
NOMO3-201ENST00000263012 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NOMO3-201ENST00000263012 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NOMO3-201ENST00000263012 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NOMO3-201ENST00000263012 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NOMO3-201ENST00000263012 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 SKAP1Q86WV1 359 aa23.2■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 WDR97A6NE52 1622 aa23.19■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.19■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.18■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.16■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.15■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 IGF1RP08069 1367 aa23.15■■□□□ 1.3
NOMO3-201ENST00000263012 IL27Q8NEV9 243 aa23.13■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.12■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 PDE4AP27815 886 aa23.11■■□□□ 1.29
NOMO3-201ENST00000263012 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.11■■□□□ 1.29
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