RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.72■■□□□ 1.07
LAMC1-201ENST00000258341 BECN1Q14457 450 aa21.69■■□□□ 1.06
LAMC1-201ENST00000258341 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.69■■□□□ 1.06
LAMC1-201ENST00000258341 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
LAMC1-201ENST00000258341 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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LAMC1-201ENST00000258341 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
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LAMC1-201ENST00000258341 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LAMC1-201ENST00000258341 SCRIBQ14160 1630 aa21.63■■□□□ 1.05
LAMC1-201ENST00000258341 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
LAMC1-201ENST00000258341 MRS2Q9HD23 443 aa21.62■■□□□ 1.05
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LAMC1-201ENST00000258341 TSPY10P0CW01 314 aa21.6■■□□□ 1.05
LAMC1-201ENST00000258341 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.58■■□□□ 1.05
LAMC1-201ENST00000258341 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA2Q08379 1002 aa21.48■■□□□ 1.03
LAMC1-201ENST00000258341 CLSTN1O94985 981 aa21.47■■□□□ 1.03
LAMC1-201ENST00000258341 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LAMC1-201ENST00000258341 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LAMC1-201ENST00000258341 PLCB2Q00722 1185 aa21.45■■□□□ 1.02
LAMC1-201ENST00000258341 FGD1P98174 961 aa21.43■■□□□ 1.02
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LAMC1-201ENST00000258341 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
LAMC1-201ENST00000258341 CFAP53Q96M91 514 aa21.41■■□□□ 1.02
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LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.4■■□□□ 1.02
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LAMC1-201ENST00000258341 RGL3Q3MIN7 710 aa21.37■■□□□ 1.01
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LAMC1-201ENST00000258341 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
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LAMC1-201ENST00000258341 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.2■□□□□ 0.98
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LAMC1-201ENST00000258341 PDE4CQ08493 712 aa20.91■□□□□ 0.94
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LAMC1-201ENST00000258341 G3V3G9 751 aa20.86■□□□□ 0.93
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