RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa6.13□□□□□ -1.43
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znf516Q7TSH3 1157 aa6.1□□□□□ -1.43
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atad2Q8CDM1 1040 aa6.1□□□□□ -1.43
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm13697A2AK42 830 aa6.09□□□□□ -1.43
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pde4dQ01063 747 aa6.09□□□□□ -1.43
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zbtb7bQ64321 544 aa6.08□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MycnP03966 462 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ndufv2Q9D6J6 248 aa6.07□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tulp1Q9Z273 543 aa6.07□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 St18Q80TY4 1045 aa6.06□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kank4Q6P9J5 1016 aa6.05□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pak3Q61036 559 aa6.04□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ZxdbA2CE44 873 aa6.03□□□□□ -1.44
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam181bQ80VF6 417 aa6.02□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Repin1Q5U4E2 545 aa6.01□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam117bQ3U3E2 584 aa6□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hmx1O70218 332 aa5.98□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prim1P20664 417 aa5.97□□□□□ -1.45
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znf579Q80VM4 562 aa5.96□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Scarf1Q5ND28 820 aa5.95□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Axin1O35625 863 aa5.94□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 C1qbpO35658 278 aa5.94□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ecm2Q5FW85 670 aa5.94□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A0A1Y7VJH8 109 aa5.93□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa5.93□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa5.93□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Jph4Q80WT0 628 aa5.92□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 EdaraddQ8VHX2 208 aa5.92□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lce6aD3YV94 81 aa5.91□□□□□ -1.46
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pcdhb17Q91VD8 799 aa5.87□□□□□ -1.47
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dkk1O54908 272 aa5.85□□□□□ -1.47
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fndc3aQ8BX90 1198 aa5.84□□□□□ -1.47
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Msh5Q9QUM7 833 aa5.84□□□□□ -1.47
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Scnn1bQ9WU38 638 aa5.84□□□□□ -1.47
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Thap8E9Q695 213 aa5.83□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 RragcQ99K70 398 aa5.83□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Irx5Q9JKQ4 484 aa5.82□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ier5lQ99J55 406 aa5.81□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ElnP54320 860 aa5.8□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Evi5P97366 809 aa5.8□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm11555B1AQ89 175 aa5.79□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm11563B1AQ90 168 aa5.79□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PsdQ5DTT2 1024 aa5.79□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Krtap4-7Q9D732 168 aa5.79□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nap1l5Q9JJF0 156 aa5.78□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sall2Q9QX96 1004 aa5.78□□□□□ -1.48
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Chrm1P12657 460 aa5.77□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Spock2Q9ER58 423 aa5.77□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnf166Q3U9F6 237 aa5.76□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fkbp4P30416 458 aa5.75□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ano8Q6PB70 1060 aa5.73□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Actn4P57780 912 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Smpd1Q04519 627 aa5.72□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gga1Q8R0H9 635 aa5.72□□□□□ -1.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Myt1lP97500 1187 aa5.71□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ferd3lQ923Z4 168 aa5.71□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Apba1B2RUJ5 842 aa5.7□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 E9Q0B3 247 aa5.7□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Setdb2Q8C267 713 aa5.69□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa5.67□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ankrd65F6YK91 380 aa5.67□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dnm1lQ8K1M6 742 aa5.67□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kdm2aP59997 1161 aa5.66□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Neurod1Q60867 357 aa5.66□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 TimelessQ9R1X4 1197 aa5.66□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stk3Q9JI10 497 aa5.65□□□□□ -1.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Otop3Q80UF9 577 aa5.63□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hoxa2P31245 372 aa5.62□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa5.62□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A0A1Y7VLE6 161 aa5.6□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sptlc1O35704 473 aa5.6□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tox2A2A472 547 aa5.59□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CatipB9EKE5 520 aa5.59□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa5.59□□□□□ -1.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa5.57□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa5.56□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa5.56□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mier1Q5UAK0 511 aa5.55□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stk24Q99KH8 431 aa5.55□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Znf354bQ9QXT9 601 aa5.54□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lhx6Q9R1R0 363 aa5.54□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pbx2O35984 430 aa5.53□□□□□ -1.52
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Erich4Q3UNU4 136 aa5.52□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Arid3aQ62431 601 aa5.52□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mnx1Q9QZW9 404 aa5.52□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Stk25Q9Z2W1 426 aa5.51□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Klra4Q60651 263 aa5.5□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Onecut3Q8K557 490 aa5.5□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm11939A2A592 99 aa5.49□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prdm16A2A935 1275 aa5.49□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gabbr2Q80T41 940 aa5.49□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Crim1Q9JLL0 1037 aa5.49□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Erbb3Q61526 1339 aa5.48□□□□□ -1.53
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Skap1Q3UUV5 355 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.7 ms